More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1811 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.29 
 
 		 464 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.65 
 
 		 468 aa  771    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 		 466 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.08 
 
 		 465 aa  794    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 465 aa  945    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.78 
 
 		 464 aa  766    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.57 
 
 		 464 aa  772    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.39 
 
 		 463 aa  756    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 465 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.03 
 
 		 470 aa  608  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.71 
 
 		 465 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.04 
 
 		 469 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.3 
 
 		 465 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.32 
 
 		 466 aa  602  1.0000000000000001e-171  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 478 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.92 
 
 		 477 aa  598  1e-170  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 		 478 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.91 
 
 		 465 aa  598  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.81 
 
 		 473 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.1 
 
 		 473 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.76 
 
 		 479 aa  592  1e-168  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.6 
 
 		 473 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.02 
 
 		 472 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.46 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.25 
 
 		 479 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.55 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.17 
 
 		 465 aa  590  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.08 
 
 		 479 aa  589  1e-167  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.21 
 
 		 480 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.72 
 
 		 480 aa  581  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.37 
 
 		 487 aa  579  1e-164  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.54 
 
 		 487 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.21 
 
 		 487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 		 539 aa  572  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.09 
 
 		 477 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.67 
 
 		 481 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.18 
 
 		 471 aa  568  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.67 
 
 		 481 aa  565  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.92 
 
 		 482 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.32 
 
 		 486 aa  556  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.74 
 
 		 481 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  51.65 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  49.46 
 
 		 463 aa  488  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.3 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.83 
 
 		 474 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.86 
 
 		 491 aa  461  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 		 468 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 		 466 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 465 aa  451  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.48 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.81 
 
 		 465 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  48.38 
 
 		 464 aa  441  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 		 457 aa  411  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  46.24 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 470 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.94 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.46 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.02 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 		 473 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.57 
 
 		 474 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.21 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 		 473 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 		 472 aa  364  2e-99  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 467 aa  362  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 469 aa  360  3e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.6 
 
 		 464 aa  359  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 		 471 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 		 473 aa  350  3e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 		 473 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 		 469 aa  348  2e-94  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 		 462 aa  347  3e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.46 
 
 		 468 aa  346  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 		 461 aa  345  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.5 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 		 468 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 		 476 aa  341  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.18 
 
 		 467 aa  341  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>