More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3003 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  949    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.84 
 
 		 471 aa  853    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.68 
 
 		 470 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.35 
 
 		 465 aa  550  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.29 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 465 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.61 
 
 		 468 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.3 
 
 		 465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.96 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.93 
 
 		 466 aa  438  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.5 
 
 		 462 aa  438  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 481 aa  435  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.93 
 
 		 473 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.72 
 
 		 465 aa  434  1e-120  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.03 
 
 		 471 aa  433  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.4 
 
 		 473 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.83 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.72 
 
 		 477 aa  426  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 		 473 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.03 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.76 
 
 		 479 aa  424  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 470 aa  423  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.4 
 
 		 468 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.28 
 
 		 472 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.55 
 
 		 473 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 		 478 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.07 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.28 
 
 		 468 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.2 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.02 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  48.08 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.42 
 
 		 462 aa  417  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 466 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.03 
 
 		 465 aa  418  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.04 
 
 		 478 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 466 aa  416  9.999999999999999e-116  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.87 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.31 
 
 		 466 aa  414  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 		 479 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.69 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 		 487 aa  411  1e-113  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.75 
 
 		 539 aa  409  1e-113  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.9 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.35 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.51 
 
 		 477 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.54 
 
 		 487 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.82 
 
 		 465 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.92 
 
 		 463 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 		 487 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 		 481 aa  398  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  48.11 
 
 		 478 aa  392  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.17 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.76 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 		 464 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.44 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 		 471 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 486 aa  390  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 		 467 aa  390  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.13 
 
 		 466 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.33 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.56 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.61 
 
 		 469 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  43.79 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.92 
 
 		 468 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 		 468 aa  385  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.59 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.82 
 
 		 464 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.91 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.09 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 467 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.94 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.09 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.98 
 
 		 464 aa  382  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.85 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.7 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 		 473 aa  375  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.23 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.55 
 
 		 465 aa  376  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.01 
 
 		 466 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 		 458 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.43 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 		 467 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44 
 
 		 473 aa  372  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.88 
 
 		 484 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 		 467 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.79 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>