More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1439 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
469 aa  936    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.74 
 
 
469 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.26 
 
 
474 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.21 
 
 
473 aa  483  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.08 
 
 
483 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.8 
 
 
472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
465 aa  379  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
474 aa  379  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.61 
 
 
462 aa  380  1e-104  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.25 
 
 
465 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 
466 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
468 aa  371  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
473 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
465 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.02 
 
 
465 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 
462 aa  364  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 
487 aa  363  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.72 
 
 
468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  42.16 
 
 
464 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
465 aa  360  2e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
462 aa  356  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
464 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
468 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  42 
 
 
478 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 
479 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
479 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
468 aa  353  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
479 aa  352  8e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
464 aa  352  1e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
477 aa  351  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
466 aa  350  2e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  41.24 
 
 
478 aa  350  3e-95  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
472 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 
479 aa  347  2e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 
465 aa  348  2e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
481 aa  347  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
464 aa  347  4e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 
465 aa  346  5e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.11 
 
 
465 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
473 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 
473 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
487 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
487 aa  343  5e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
480 aa  343  5e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 
467 aa  343  5.999999999999999e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
463 aa  342  5.999999999999999e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
470 aa  342  7e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 
481 aa  342  9e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
466 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
467 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
481 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.67 
 
 
539 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 
465 aa  341  2e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
478 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
471 aa  340  5e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.45 
 
 
466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
482 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.45 
 
 
466 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 
466 aa  338  8e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
465 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.96 
 
 
470 aa  336  5.999999999999999e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
462 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
477 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
461 aa  334  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.6 
 
 
492 aa  333  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
465 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
465 aa  332  8e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
471 aa  332  1e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.92 
 
 
467 aa  331  2e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.12 
 
 
463 aa  331  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 
457 aa  330  4e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 
463 aa  328  9e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.67 
 
 
486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.14 
 
 
581 aa  326  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
466 aa  326  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  326  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
470 aa  325  8.000000000000001e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
467 aa  324  2e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 
491 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 
473 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 
476 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.4 
 
 
471 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
466 aa  323  5e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
462 aa  322  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.23 
 
 
470 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>