More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2323 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
467 aa  947    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  59 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  59 
 
 
464 aa  538  9.999999999999999e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.85 
 
 
599 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.42 
 
 
619 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
625 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 
470 aa  432  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.88 
 
 
607 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
680 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.03 
 
 
588 aa  423  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.82 
 
 
470 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.93 
 
 
579 aa  418  1e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.81 
 
 
581 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.12 
 
 
474 aa  421  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  47.94 
 
 
474 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  47.94 
 
 
474 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.59 
 
 
603 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 
602 aa  417  9.999999999999999e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.59 
 
 
603 aa  417  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.34 
 
 
593 aa  418  9.999999999999999e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 
594 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.95 
 
 
463 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.46 
 
 
464 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.98 
 
 
469 aa  410  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.66 
 
 
473 aa  408  1e-113  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.72 
 
 
477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 
474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.48 
 
 
463 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.17 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 
605 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  46.19 
 
 
475 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.71 
 
 
462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.49 
 
 
492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.22 
 
 
465 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.39 
 
 
475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.06 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.67 
 
 
593 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
475 aa  402  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
475 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 
474 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 
475 aa  403  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03462  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.17 
 
 
476 aa  404  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.17 
 
 
474 aa  403  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.48 
 
 
463 aa  404  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.72 
 
 
476 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.93 
 
 
466 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.78 
 
 
479 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.52 
 
 
475 aa  404  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.61 
 
 
474 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 
474 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 
476 aa  402  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 
476 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
474 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  48.04 
 
 
473 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.42 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.72 
 
 
476 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.52 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.49 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.57 
 
 
470 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.15 
 
 
600 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  46.64 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
594 aa  399  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 
626 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.72 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.14 
 
 
470 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.45 
 
 
462 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.55 
 
 
481 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 
474 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  402  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.72 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.09 
 
 
475 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
495 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
470 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.26 
 
 
462 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 
476 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 
484 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.74 
 
 
474 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 
484 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.51 
 
 
476 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.64 
 
 
475 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>