More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3566 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  925    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  925    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.74 
 
 		 476 aa  846    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.57 
 
 		 474 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4805  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.42 
 
 		 477 aa  698    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.46 
 
 		 474 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.05 
 
 		 475 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.36 
 
 		 474 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.36 
 
 		 475 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03223  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.91 
 
 		 473 aa  734    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.416876  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  925    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.46 
 
 		 474 aa  907    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.57 
 
 		 474 aa  924    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  924    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03462  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.39 
 
 		 476 aa  846    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.26 
 
 		 475 aa  834    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 		 589 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.42 
 
 		 475 aa  826    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.94 
 
 		 474 aa  916    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.05 
 
 		 475 aa  838    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.36 
 
 		 474 aa  922    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 		 588 aa  635    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.42 
 
 		 475 aa  826    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  93.46 
 
 		 475 aa  907    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 		 590 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.39 
 
 		 475 aa  833    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.65 
 
 		 685 aa  645    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.94 
 
 		 474 aa  915    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.95 
 
 		 474 aa  952    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.89 
 
 		 476 aa  835    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  957    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0321  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.14 
 
 		 476 aa  835    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0683294 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.15 
 
 		 474 aa  918    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 495 aa  926    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 495 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  925    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  86.5 
 
 		 475 aa  848    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  88.4 
 
 		 475 aa  865    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.51 
 
 		 474 aa  912    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 		 588 aa  635    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3352  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.6 
 
 		 474 aa  771    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000157637  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0421  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.13 
 
 		 475 aa  852    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000187748  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.65 
 
 		 474 aa  832    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0430  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.05 
 
 		 475 aa  839    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.26 
 
 		 475 aa  840    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.23 
 
 		 475 aa  842    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.42 
 
 		 476 aa  832    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  84.63 
 
 		 475 aa  828    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3415  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.05 
 
 		 475 aa  836    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000233503  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  87.76 
 
 		 475 aa  857    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  95.78 
 
 		 474 aa  925    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.59 
 
 		 474 aa  808    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.6 
 
 		 588 aa  634  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 589 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 588 aa  631  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.6 
 
 		 592 aa  632  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 592 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.96 
 
 		 600 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  65.96 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.96 
 
 		 603 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.27 
 
 		 593 aa  618  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.13 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0510  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  63.62 
 
 		 470 aa  619  1e-176  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0251745  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1944  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.48 
 
 		 593 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0868874  hitchhiker  0.000336212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  64.92 
 
 		 474 aa  616  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.87 
 
 		 594 aa  611  9.999999999999999e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.08 
 
 		 587 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.89 
 
 		 625 aa  608  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  61.89 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  61.89 
 
 		 474 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1199  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.44 
 
 		 592 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000025561  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.23 
 
 		 680 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1306  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.64 
 
 		 593 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.77 
 
 		 599 aa  598  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.06 
 
 		 588 aa  598  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1603  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.75 
 
 		 594 aa  595  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00100727  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.03 
 
 		 619 aa  595  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.67 
 
 		 591 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.11 
 
 		 602 aa  583  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1966  dihydrolipoyl dehydrogenase  62.63 
 
 		 580 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258169  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.86 
 
 		 594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.08 
 
 		 605 aa  584  1.0000000000000001e-165  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.21 
 
 		 590 aa  577  1.0000000000000001e-163  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.47 
 
 		 607 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.71 
 
 		 610 aa  564  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.88 
 
 		 626 aa  555  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.87 
 
 		 603 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.62 
 
 		 593 aa  555  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.66 
 
 		 603 aa  553  1e-156  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  60.26 
 
 		 473 aa  548  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 594 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>