More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0353 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.71 
 
 		 607 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1468  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.75 
 
 		 685 aa  650    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0186247  normal  0.515746 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.07 
 
 		 602 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.2 
 
 		 619 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.26 
 
 		 594 aa  710    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2589  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.29 
 
 		 600 aa  641    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  decreased coverage  0.000383256 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 		 626 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.28 
 
 		 593 aa  649    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1866  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  58.91 
 
 		 589 aa  635    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.97 
 
 		 579 aa  810    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 		 588 aa  665    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  58 
 
 		 603 aa  645    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.110052  normal  0.0211512 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1554  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.4 
 
 		 589 aa  672    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1966  dihydrolipoyl dehydrogenase  61.63 
 
 		 580 aa  668    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258169  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.63 
 
 		 680 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 594 aa  1185    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.68 
 
 		 593 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2172  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 		 588 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.36 
 
 		 599 aa  669    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1135  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.25 
 
 		 589 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.373004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1086  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.59 
 
 		 587 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0812203  normal  0.813461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4916  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3247  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 		 595 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.639352 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.94 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1719  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 589 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0148218  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2096  dihydrolipoamide dehydrogenase  57 
 
 		 616 aa  629  1e-179  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.210569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 592 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2610  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.56 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.94 
 
 		 603 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5942  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.89 
 
 		 588 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00253524  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1500  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 589 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.628337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2228  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 589 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.467573  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6503  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.65 
 
 		 592 aa  631  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.120205  normal  0.402945 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3092  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 589 aa  628  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0122251  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2135  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.89 
 
 		 588 aa  629  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2743  pyruvate dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 589 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5441  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.06 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5336  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.55 
 
 		 590 aa  627  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.110925  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0736  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.93 
 
 		 594 aa  627  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.871473  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2665  pyruvate dehydrogenase complex E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  57.56 
 
 		 589 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2153  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 		 590 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0291933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.84 
 
 		 607 aa  619  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.459857 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1784  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.79 
 
 		 621 aa  615  1e-175  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978401 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1944  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.28 
 
 		 593 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0868874  hitchhiker  0.000336212 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.61 
 
 		 593 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00163952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0440  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.73 
 
 		 591 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.46872  normal  0.0861409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2669  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.1 
 
 		 614 aa  605  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2165  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.18 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.327793  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1306  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.45 
 
 		 593 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3002  pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  65.47 
 
 		 473 aa  601  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1659  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.01 
 
 		 619 aa  598  1e-170  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.349969  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.74 
 
 		 625 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2126  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.09 
 
 		 595 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.163333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.37 
 
 		 605 aa  594  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1603  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.1 
 
 		 594 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00100727  normal  0.394901 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2214  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.66 
 
 		 619 aa  591  1e-167  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.630644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2123  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.74 
 
 		 627 aa  590  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3978  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.86 
 
 		 614 aa  585  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.198165  decreased coverage  0.00908444 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1199  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.78 
 
 		 592 aa  579  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000025561  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2464  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.93 
 
 		 617 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1917  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.08 
 
 		 609 aa  567  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0149051 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0571  dihydrolipoyl dehydrogenase, E3 component of pyruvate dehydrogenases complex  61.19 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.19 
 
 		 474 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.99 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.99 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.99 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 495 aa  556  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.99 
 
 		 475 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.77 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5611  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.85 
 
 		 573 aa  555  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.236568 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.32 
 
 		 474 aa  552  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.56 
 
 		 474 aa  553  1e-156  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.56 
 
 		 474 aa  554  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.14 
 
 		 474 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 474 aa  549  1e-155  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.51 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.72 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.32 
 
 		 475 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.29 
 
 		 474 aa  545  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.51 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2925  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.28 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.324893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.32 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.51 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.14 
 
 		 474 aa  546  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.32 
 
 		 475 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.97 
 
 		 475 aa  546  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0426  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.11 
 
 		 475 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.11 
 
 		 475 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.02 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3429  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0358795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.84 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03462  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.18 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.81 
 
 		 475 aa  543  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>