More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4269 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 462 aa  917    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 		 581 aa  474  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.45 
 
 		 463 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.87 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.18 
 
 		 462 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.68 
 
 		 467 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.85 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.48 
 
 		 467 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.8 
 
 		 469 aa  452  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.7 
 
 		 467 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.54 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.84 
 
 		 480 aa  448  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.3 
 
 		 464 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.85 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.47 
 
 		 466 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.84 
 
 		 467 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.52 
 
 		 468 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.7 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.95 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.73 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.71 
 
 		 467 aa  442  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.93 
 
 		 467 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.13 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.53 
 
 		 463 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.97 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.47 
 
 		 466 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.4 
 
 		 467 aa  435  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.09 
 
 		 463 aa  438  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 467 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.71 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 467 aa  429  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.35 
 
 		 467 aa  426  1e-118  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.82 
 
 		 465 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.24 
 
 		 466 aa  428  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 		 466 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.13 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.14 
 
 		 471 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.35 
 
 		 466 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.08 
 
 		 470 aa  421  1e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  48.59 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 470 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 		 467 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.72 
 
 		 470 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  48.82 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.08 
 
 		 462 aa  414  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.02 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 		 475 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.7 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.63 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.63 
 
 		 468 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.73 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.91 
 
 		 481 aa  399  9.999999999999999e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.51 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  45.71 
 
 		 466 aa  402  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.72 
 
 		 476 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.62 
 
 		 483 aa  396  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.33 
 
 		 466 aa  396  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  44.78 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 		 476 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.89 
 
 		 476 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  46.42 
 
 		 511 aa  394  1e-108  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 		 476 aa  393  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.62 
 
 		 475 aa  392  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.48 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.3 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.77 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.89 
 
 		 476 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.3 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0751  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.88 
 
 		 459 aa  390  1e-107  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 476 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.84 
 
 		 477 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 		 460 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.95 
 
 		 484 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.9 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.08 
 
 		 472 aa  386  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 478 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.37 
 
 		 489 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 478 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.89 
 
 		 475 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.09 
 
 		 475 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 		 463 aa  382  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>