More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2832 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  917    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.79 
 
 
458 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.74 
 
 
463 aa  411  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.15 
 
 
458 aa  410  1e-113  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
465 aa  395  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.79 
 
 
470 aa  394  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 
468 aa  394  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 
462 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.33 
 
 
562 aa  388  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
472 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
473 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.56 
 
 
461 aa  385  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.01 
 
 
465 aa  387  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
465 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 
473 aa  382  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
473 aa  382  1e-105  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.62 
 
 
459 aa  383  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 
473 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.09 
 
 
473 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.41 
 
 
470 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 
466 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
480 aa  381  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 
459 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.39 
 
 
474 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.59 
 
 
459 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.71 
 
 
459 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 
477 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 
459 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
468 aa  380  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 
471 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.91 
 
 
464 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.06 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
462 aa  381  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.49 
 
 
459 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.06 
 
 
473 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
472 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 
462 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
487 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 
482 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
474 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.05 
 
 
459 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
539 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
487 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
459 aa  373  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 
465 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 
481 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.27 
 
 
459 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  43.96 
 
 
464 aa  372  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
459 aa  373  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.05 
 
 
465 aa  371  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 
459 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
480 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
466 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 
468 aa  369  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
465 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.08 
 
 
467 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.59 
 
 
464 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.02 
 
 
471 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
459 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 
467 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 
470 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 
467 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 
471 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
602 aa  367  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
481 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.79 
 
 
466 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.93 
 
 
481 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.39 
 
 
467 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
469 aa  365  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
486 aa  365  1e-99  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
480 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
479 aa  364  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 
467 aa  364  2e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.44 
 
 
479 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
465 aa  363  3e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 
625 aa  362  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
487 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
467 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  42.23 
 
 
462 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.38 
 
 
470 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.18 
 
 
464 aa  361  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 
467 aa  360  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
462 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  42.73 
 
 
468 aa  360  4e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.35 
 
 
477 aa  359  6e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
472 aa  358  8e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
478 aa  358  8e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.36 
 
 
619 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.64 
 
 
477 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>