More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4074 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
461 aa  912    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.77 
 
 
562 aa  402  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  45.61 
 
 
462 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2747  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.55 
 
 
469 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.56 
 
 
463 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 
466 aa  376  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
463 aa  372  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
458 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.09 
 
 
459 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 
458 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
465 aa  352  8e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  42.58 
 
 
466 aa  351  1e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 
463 aa  348  8e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.29 
 
 
459 aa  348  9e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.69 
 
 
585 aa  347  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  39.96 
 
 
468 aa  345  7e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 
470 aa  345  7e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
462 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
467 aa  344  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
477 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
468 aa  343  2.9999999999999997e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
454 aa  342  8e-93  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.18 
 
 
581 aa  341  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 
469 aa  340  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
473 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.37 
 
 
478 aa  338  9e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
616 aa  338  9.999999999999999e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
478 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 
464 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 
496 aa  336  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
460 aa  336  5.999999999999999e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
470 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
468 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
468 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
468 aa  335  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
478 aa  334  2e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  41.03 
 
 
500 aa  333  4e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 
474 aa  333  4e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
471 aa  333  5e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
481 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
462 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
467 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
467 aa  332  1e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.38 
 
 
464 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
467 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
467 aa  331  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
478 aa  330  2e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
467 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
451 aa  330  2e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
468 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
459 aa  330  3e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.43 
 
 
466 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
467 aa  330  4e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0546  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
449 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.614447  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
449 aa  329  6e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
468 aa  328  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
476 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
474 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
476 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 
462 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
466 aa  327  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.94 
 
 
467 aa  327  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
464 aa  327  3e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 
462 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 
459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
584 aa  327  4.0000000000000003e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
471 aa  326  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
476 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.87 
 
 
474 aa  326  7e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
465 aa  325  1e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
463 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 
466 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 
462 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 
594 aa  325  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 
450 aa  324  2e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 
478 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
476 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
478 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
476 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
476 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
470 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
470 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
466 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
459 aa  323  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
462 aa  324  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
467 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 
478 aa  322  6e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
465 aa  322  7e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
460 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>