More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0365 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.22 
 
 
458 aa  740    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
458 aa  919    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.31 
 
 
459 aa  510  1e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.96 
 
 
463 aa  405  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.81 
 
 
463 aa  403  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
471 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
465 aa  384  1e-105  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 
473 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 
562 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.53 
 
 
473 aa  379  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.96 
 
 
473 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
470 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 
473 aa  376  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
462 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.78 
 
 
473 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
465 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
470 aa  372  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.42 
 
 
468 aa  372  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 
468 aa  372  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 
469 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.2 
 
 
467 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.08 
 
 
459 aa  364  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
466 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.41 
 
 
478 aa  363  3e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
472 aa  363  3e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
460 aa  363  4e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 
462 aa  363  4e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.68 
 
 
473 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 
470 aa  362  9e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 
468 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 
470 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  42.64 
 
 
462 aa  359  6e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.83 
 
 
465 aa  358  9e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
478 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
470 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 
470 aa  355  8.999999999999999e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
496 aa  354  1e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
472 aa  353  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.42 
 
 
476 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
474 aa  354  2e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
462 aa  353  4e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.38 
 
 
461 aa  353  4e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.92 
 
 
470 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 
581 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
462 aa  351  1e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
477 aa  351  1e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
465 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.11 
 
 
459 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
470 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
470 aa  350  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
470 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
466 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  350  3e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.01 
 
 
450 aa  350  3e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 
476 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.41 
 
 
468 aa  349  7e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  9e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  9e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
467 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
470 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
479 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 
476 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
464 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
467 aa  348  2e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
471 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.09 
 
 
464 aa  348  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.9 
 
 
468 aa  347  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 
476 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
464 aa  347  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
459 aa  346  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.99 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.32 
 
 
459 aa  346  6e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.76 
 
 
470 aa  346  6e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
476 aa  346  6e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 
464 aa  346  6e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
459 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
459 aa  345  7e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
467 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
471 aa  345  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 
598 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>