More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4304 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
471 aa  958    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.61 
 
 
465 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.01 
 
 
465 aa  419  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.11 
 
 
470 aa  419  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.06 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.62 
 
 
465 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.38 
 
 
464 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.3 
 
 
471 aa  415  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.15 
 
 
464 aa  409  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  47.55 
 
 
464 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.72 
 
 
471 aa  412  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.38 
 
 
474 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.2 
 
 
468 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.11 
 
 
465 aa  403  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
462 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 
471 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
473 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.97 
 
 
473 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
462 aa  385  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.43 
 
 
464 aa  378  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.38 
 
 
467 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
468 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.03 
 
 
465 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.65 
 
 
473 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
468 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 
487 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 
478 aa  372  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 
477 aa  373  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.44 
 
 
472 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.6 
 
 
473 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.18 
 
 
473 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  372  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
473 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
467 aa  370  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
461 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
476 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 
464 aa  369  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  41.52 
 
 
457 aa  365  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 
482 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 
466 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.65 
 
 
466 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 
465 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.59 
 
 
481 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
465 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
480 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
481 aa  364  2e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
466 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
465 aa  363  3e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
466 aa  363  3e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
476 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
476 aa  363  4e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  362  6e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
466 aa  362  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.73 
 
 
468 aa  361  1e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 
460 aa  360  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
466 aa  360  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
476 aa  360  4e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
464 aa  359  5e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 
466 aa  359  6e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.25 
 
 
487 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
476 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.23 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 
467 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.67 
 
 
476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.12 
 
 
486 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
466 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
465 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
479 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
470 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 
470 aa  355  6.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
479 aa  355  1e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.28 
 
 
470 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
465 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 
480 aa  354  1e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.46 
 
 
479 aa  354  2e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.34 
 
 
461 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.37 
 
 
477 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>