More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3518 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.53 
 
 		 467 aa  643    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 		 466 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 		 468 aa  639    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.83 
 
 		 464 aa  670    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.89 
 
 		 464 aa  735    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.11 
 
 		 467 aa  668    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.81 
 
 		 461 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.67 
 
 		 467 aa  636    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 464 aa  946    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.3 
 
 		 465 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.02 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.02 
 
 		 466 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.24 
 
 		 464 aa  627  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.81 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.73 
 
 		 460 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.09 
 
 		 466 aa  612  9.999999999999999e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.85 
 
 		 461 aa  599  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.33 
 
 		 467 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10469  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.73 
 
 		 464 aa  581  1e-164  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.17 
 
 		 465 aa  425  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.97 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.09 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.45 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  46.47 
 
 		 464 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.61 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.13 
 
 		 472 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 473 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 		 473 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.78 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.19 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.88 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.03 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.69 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.82 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 474 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 		 464 aa  389  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.57 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.77 
 
 		 462 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.86 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.07 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 471 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.81 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.03 
 
 		 487 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 		 539 aa  381  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.84 
 
 		 479 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 479 aa  382  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.33 
 
 		 478 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.17 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.47 
 
 		 481 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 		 465 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 		 466 aa  372  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.63 
 
 		 463 aa  372  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.08 
 
 		 478 aa  369  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.06 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.43 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.32 
 
 		 470 aa  366  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 465 aa  365  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 		 471 aa  365  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.44 
 
 		 470 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  45 
 
 		 469 aa  363  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.47 
 
 		 481 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.33 
 
 		 471 aa  362  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.3 
 
 		 466 aa  362  1e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 469 aa  358  8e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.29 
 
 		 481 aa  358  9.999999999999999e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 		 473 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 		 465 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  44.14 
 
 		 478 aa  355  7.999999999999999e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 463 aa  355  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 		 467 aa  351  2e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.42 
 
 		 465 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.2 
 
 		 467 aa  350  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.3 
 
 		 581 aa  349  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 		 473 aa  349  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 		 471 aa  348  9e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 		 486 aa  345  8e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 		 471 aa  345  8.999999999999999e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 		 468 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 463 aa  341  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 471 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.7 
 
 		 457 aa  340  4e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 476 aa  339  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 		 462 aa  338  9.999999999999999e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.92 
 
 		 476 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 		 476 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 		 476 aa  334  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 457 aa  334  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 		 467 aa  334  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 		 466 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>