More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2755 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  930    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.19 
 
 		 465 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.52 
 
 		 466 aa  544  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.88 
 
 		 478 aa  534  1e-150  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.88 
 
 		 479 aa  529  1e-149  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.88 
 
 		 478 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.67 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.23 
 
 		 465 aa  522  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.73 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.58 
 
 		 464 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.42 
 
 		 479 aa  522  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.94 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.86 
 
 		 466 aa  519  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.14 
 
 		 465 aa  520  1e-146  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.25 
 
 		 479 aa  521  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.6 
 
 		 463 aa  514  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.75 
 
 		 473 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.98 
 
 		 480 aa  515  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.44 
 
 		 480 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.81 
 
 		 481 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.14 
 
 		 477 aa  511  1e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.51 
 
 		 473 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.87 
 
 		 464 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.17 
 
 		 481 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.37 
 
 		 473 aa  506  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.93 
 
 		 465 aa  504  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.49 
 
 		 473 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.08 
 
 		 487 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.57 
 
 		 465 aa  504  1e-141  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.92 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.01 
 
 		 465 aa  499  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.76 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.3 
 
 		 487 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.15 
 
 		 481 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.1 
 
 		 539 aa  495  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.39 
 
 		 482 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 		 472 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 		 486 aa  489  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 		 470 aa  489  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.2 
 
 		 469 aa  490  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.67 
 
 		 477 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.14 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 468 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 		 462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.26 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.39 
 
 		 465 aa  445  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.74 
 
 		 468 aa  444  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.26 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.49 
 
 		 465 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  51.17 
 
 		 464 aa  441  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.14 
 
 		 462 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  45.82 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 		 457 aa  413  1e-114  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 465 aa  409  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.96 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.81 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 471 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.83 
 
 		 470 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  47.97 
 
 		 478 aa  394  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.94 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 		 471 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.67 
 
 		 463 aa  362  9e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 474 aa  356  5e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 		 476 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.17 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  8e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  8e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 		 463 aa  351  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.33 
 
 		 476 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 		 476 aa  351  1e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  352  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 		 476 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.14 
 
 		 476 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.93 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.85 
 
 		 457 aa  349  6e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 468 aa  348  8e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 		 473 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.74 
 
 		 474 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 		 581 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 		 467 aa  347  3e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.12 
 
 		 476 aa  346  4e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 		 467 aa  346  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 		 469 aa  345  7e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 		 468 aa  345  8e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.8 
 
 		 464 aa  345  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 		 466 aa  345  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 		 474 aa  344  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 478 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 		 467 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>