More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2045 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.56 
 
 		 478 aa  837    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 		 476 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.99 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.41 
 
 		 476 aa  756    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.46 
 
 		 474 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 474 aa  960    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.99 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.41 
 
 		 476 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 		 478 aa  700    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.67 
 
 		 496 aa  702    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.83 
 
 		 476 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.64 
 
 		 478 aa  699    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.99 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 		 476 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.78 
 
 		 476 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.41 
 
 		 476 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  85.77 
 
 		 478 aa  838    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  86.19 
 
 		 478 aa  840    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.83 
 
 		 478 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.66 
 
 		 476 aa  762    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.99 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.72 
 
 		 474 aa  878    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.47 
 
 		 598 aa  698    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.24 
 
 		 476 aa  759    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.62 
 
 		 476 aa  759    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 		 476 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.03 
 
 		 476 aa  755    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.57 
 
 		 474 aa  659    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.2 
 
 		 476 aa  754    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.55 
 
 		 478 aa  627  1e-178  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.41 
 
 		 475 aa  625  1e-178  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.99 
 
 		 475 aa  620  1e-176  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.73 
 
 		 475 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.04 
 
 		 475 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.78 
 
 		 475 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.5 
 
 		 476 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.52 
 
 		 489 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.78 
 
 		 475 aa  598  1e-170  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.4 
 
 		 481 aa  597  1e-169  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.73 
 
 		 475 aa  597  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.05 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.17 
 
 		 475 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 468 aa  555  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0855  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.56 
 
 		 483 aa  536  1e-151  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301794  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.9 
 
 		 478 aa  504  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.56 
 
 		 480 aa  504  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.01 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 		 478 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 		 478 aa  501  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.91 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 		 478 aa  495  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.37 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.91 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.81 
 
 		 478 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.14 
 
 		 581 aa  496  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.6 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.37 
 
 		 478 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.8 
 
 		 473 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.11 
 
 		 463 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.11 
 
 		 474 aa  491  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.8 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.21 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.32 
 
 		 477 aa  491  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.53 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.49 
 
 		 467 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.32 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.56 
 
 		 469 aa  478  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.11 
 
 		 467 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.29 
 
 		 467 aa  476  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.44 
 
 		 484 aa  475  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.28 
 
 		 462 aa  478  1e-133  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.2 
 
 		 468 aa  474  1e-132  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  52 
 
 		 468 aa  470  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.58 
 
 		 466 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.19 
 
 		 479 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.37 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.37 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.73 
 
 		 466 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.98 
 
 		 467 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.01 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.68 
 
 		 467 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.47 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.15 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.57 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.86 
 
 		 471 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.26 
 
 		 466 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.84 
 
 		 479 aa  457  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.47 
 
 		 467 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.36 
 
 		 467 aa  456  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 483 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.64 
 
 		 470 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  51.15 
 
 		 468 aa  453  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.89 
 
 		 467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 		 480 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0268  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.55 
 
 		 466 aa  452  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.94 
 
 		 467 aa  448  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>