More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0104 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0104  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 483 aa  974    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  97.52 
 
 		 483 aa  955    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0268  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.31 
 
 		 485 aa  888    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.16 
 
 		 478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.95 
 
 		 478 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.16 
 
 		 478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.95 
 
 		 478 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.54 
 
 		 478 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.74 
 
 		 478 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.54 
 
 		 478 aa  559  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  60.33 
 
 		 478 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.92 
 
 		 478 aa  552  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.12 
 
 		 478 aa  550  1e-155  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.41 
 
 		 479 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.97 
 
 		 477 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.94 
 
 		 480 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2798  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.26 
 
 		 479 aa  530  1e-149  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5793  normal  0.535486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.87 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.3 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2632  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.05 
 
 		 478 aa  496  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.586503 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0886  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 		 478 aa  491  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0800  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.26 
 
 		 478 aa  488  1e-137  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.52 
 
 		 473 aa  484  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2607  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.83 
 
 		 474 aa  478  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00261038 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.99 
 
 		 476 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.78 
 
 		 476 aa  471  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.59 
 
 		 468 aa  473  1e-132  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.46 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.41 
 
 		 476 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.26 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.18 
 
 		 474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.05 
 
 		 476 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 		 476 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.94 
 
 		 478 aa  455  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.15 
 
 		 478 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.73 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 		 474 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 478 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 		 496 aa  449  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.65 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.1 
 
 		 478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.05 
 
 		 598 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.65 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0996  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.76 
 
 		 478 aa  432  1e-120  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000137288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2319  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 475 aa  434  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3246  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0895727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.13 
 
 		 475 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 475 aa  430  1e-119  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.540843 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1904  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 475 aa  428  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0855  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 483 aa  425  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.301794  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 468 aa  426  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.55 
 
 		 478 aa  428  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.48 
 
 		 475 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.340371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3977  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.82 
 
 		 481 aa  423  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1858  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 		 489 aa  419  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2173  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.305369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2010  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.69 
 
 		 475 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3495  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.81 
 
 		 484 aa  413  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.11068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.88 
 
 		 481 aa  411  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.63 
 
 		 467 aa  410  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2881  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 		 475 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.29 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.51 
 
 		 466 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.37 
 
 		 467 aa  402  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  48.1 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.85 
 
 		 468 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.81 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.16 
 
 		 470 aa  392  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  45.09 
 
 		 500 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.33 
 
 		 463 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.84 
 
 		 466 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.56 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  47.92 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.05 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.91 
 
 		 471 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.51 
 
 		 470 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.7 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.2 
 
 		 469 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.37 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  46.01 
 
 		 511 aa  387  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.38 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 465 aa  388  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.43 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.16 
 
 		 466 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.17 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 		 464 aa  382  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>