More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3504 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  75.27 
 
 		 464 aa  702    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.61 
 
 		 462 aa  678    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.13 
 
 		 462 aa  723    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.04 
 
 		 462 aa  682    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.98 
 
 		 464 aa  702    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 465 aa  933    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.83 
 
 		 462 aa  678    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.53 
 
 		 468 aa  549  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.34 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.34 
 
 		 480 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.55 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.11 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 468 aa  547  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.32 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.32 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.28 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.9 
 
 		 467 aa  547  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.53 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.61 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.49 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.34 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.49 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.67 
 
 		 468 aa  541  1e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.83 
 
 		 467 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.96 
 
 		 466 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 		 468 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.02 
 
 		 471 aa  538  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.24 
 
 		 468 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.47 
 
 		 470 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.24 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.79 
 
 		 466 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.46 
 
 		 466 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.87 
 
 		 463 aa  524  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.96 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.35 
 
 		 581 aa  519  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.16 
 
 		 466 aa  511  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 		 466 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 		 466 aa  510  1e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.49 
 
 		 465 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.34 
 
 		 468 aa  490  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.76 
 
 		 466 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 		 466 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.76 
 
 		 466 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.68 
 
 		 466 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.46 
 
 		 467 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.98 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.11 
 
 		 466 aa  484  1e-135  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.62 
 
 		 466 aa  481  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  52.25 
 
 		 500 aa  470  1.0000000000000001e-131  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  53.1 
 
 		 511 aa  460  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.76 
 
 		 467 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  52.14 
 
 		 466 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  52 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.26 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  51.97 
 
 		 504 aa  438  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  50.86 
 
 		 468 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.69 
 
 		 480 aa  438  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 474 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 		 479 aa  436  1e-121  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 466 aa  431  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.38 
 
 		 481 aa  425  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 		 470 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.82 
 
 		 462 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 		 467 aa  428  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 		 477 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.85 
 
 		 476 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 		 476 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 476 aa  418  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.54 
 
 		 476 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.29 
 
 		 474 aa  418  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 476 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.74 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.17 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.33 
 
 		 476 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.11 
 
 		 598 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 460 aa  414  1e-114  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.12 
 
 		 476 aa  412  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.06 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.108932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.12 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.12 
 
 		 476 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.2 
 
 		 478 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 		 459 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 		 470 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.57 
 
 		 468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.09 
 
 		 478 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.25 
 
 		 473 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.737232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.09 
 
 		 478 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.88 
 
 		 478 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.13 
 
 		 471 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>