More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0853 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
465 aa  927    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.44 
 
 
470 aa  479  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.89 
 
 
465 aa  478  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
477 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 
479 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.83 
 
 
465 aa  458  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
473 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  50 
 
 
465 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.84 
 
 
473 aa  457  1e-127  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.76 
 
 
479 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.76 
 
 
479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.85 
 
 
465 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.35 
 
 
479 aa  449  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.47 
 
 
473 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 
472 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
473 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.5 
 
 
466 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.87 
 
 
478 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.62 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.04 
 
 
466 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.25 
 
 
465 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.15 
 
 
487 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.44 
 
 
481 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.84 
 
 
465 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.33 
 
 
487 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.66 
 
 
478 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 
464 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.9 
 
 
481 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.74 
 
 
487 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.11 
 
 
481 aa  433  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 
471 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.17 
 
 
464 aa  433  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 
464 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.6 
 
 
468 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.53 
 
 
539 aa  431  1e-119  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.78 
 
 
482 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 
477 aa  431  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.65 
 
 
465 aa  431  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 
457 aa  423  1e-117  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.89 
 
 
469 aa  423  1e-117  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.97 
 
 
474 aa  419  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.28 
 
 
466 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.68 
 
 
463 aa  421  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
486 aa  416  9.999999999999999e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.69 
 
 
462 aa  416  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.81 
 
 
466 aa  413  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  43.1 
 
 
463 aa  412  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.54 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  44.95 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 
491 aa  396  1e-109  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.02 
 
 
462 aa  392  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.04 
 
 
468 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.23 
 
 
462 aa  389  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
465 aa  389  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
457 aa  377  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  44.3 
 
 
478 aa  365  1e-99  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 
462 aa  364  2e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.05 
 
 
474 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
465 aa  361  2e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
470 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.42 
 
 
473 aa  349  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
473 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.42 
 
 
467 aa  338  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
465 aa  335  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.49 
 
 
471 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 
471 aa  333  3e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
469 aa  333  5e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.42 
 
 
472 aa  332  9e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
458 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 
473 aa  329  6e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.27 
 
 
469 aa  329  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 
473 aa  329  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 
473 aa  329  8e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
466 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
467 aa  328  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.83 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
471 aa  326  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 
461 aa  325  8.000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.27 
 
 
473 aa  325  1e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.04 
 
 
473 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
467 aa  324  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
463 aa  324  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
468 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
458 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
468 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.82 
 
 
460 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.4 
 
 
471 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 
463 aa  316  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
464 aa  317  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>