More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1626 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.87 
 
 		 478 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.69 
 
 		 479 aa  732    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.64 
 
 		 481 aa  794    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.47 
 
 		 487 aa  820    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.84 
 
 		 478 aa  717    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  81.72 
 
 		 481 aa  822    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.26 
 
 		 473 aa  716    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.48 
 
 		 482 aa  802    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.05 
 
 		 479 aa  729    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.55 
 
 		 477 aa  701    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.07 
 
 		 480 aa  736    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.08 
 
 		 487 aa  828    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.9 
 
 		 473 aa  705    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.43 
 
 		 471 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.07 
 
 		 473 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.34 
 
 		 472 aa  691    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.66 
 
 		 473 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.66 
 
 		 479 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.28 
 
 		 477 aa  683    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.74 
 
 		 486 aa  769    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.6 
 
 		 480 aa  719    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.47 
 
 		 481 aa  808    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 487 aa  989    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.47 
 
 		 539 aa  819    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.07 
 
 		 479 aa  731    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.83 
 
 		 466 aa  606  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.35 
 
 		 465 aa  585  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.37 
 
 		 465 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.62 
 
 		 465 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.62 
 
 		 468 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.41 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.62 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.88 
 
 		 466 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.79 
 
 		 464 aa  566  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.88 
 
 		 463 aa  563  1.0000000000000001e-159  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.4 
 
 		 465 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.66 
 
 		 470 aa  548  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.82 
 
 		 465 aa  546  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.76 
 
 		 465 aa  541  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.16 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.05 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.45 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.08 
 
 		 466 aa  503  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.14 
 
 		 465 aa  477  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.77 
 
 		 466 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.02 
 
 		 468 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 457 aa  468  1.0000000000000001e-131  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.79 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.64 
 
 		 462 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.9 
 
 		 462 aa  449  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  47.19 
 
 		 463 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.17 
 
 		 462 aa  451  1e-125  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.94 
 
 		 468 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  49.38 
 
 		 464 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 		 491 aa  433  1e-120  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.15 
 
 		 465 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.2 
 
 		 468 aa  424  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  46.71 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.91 
 
 		 471 aa  385  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 		 461 aa  376  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.21 
 
 		 467 aa  378  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.06 
 
 		 471 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.39 
 
 		 464 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.31 
 
 		 464 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.81 
 
 		 471 aa  371  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 		 467 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 		 467 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.68 
 
 		 464 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 		 466 aa  365  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.39 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.6 
 
 		 460 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.63 
 
 		 461 aa  365  1e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 469 aa  363  3e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 		 473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 		 467 aa  360  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 		 466 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 		 462 aa  359  5e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 		 476 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 		 476 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 476 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.36 
 
 		 476 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.88 
 
 		 476 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 		 476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.36 
 
 		 476 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.35 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>