More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2549 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  946    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.31 
 
 		 473 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.06 
 
 		 473 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.58 
 
 		 473 aa  451  1.0000000000000001e-126  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.37 
 
 		 473 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.16 
 
 		 473 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 470 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.61 
 
 		 464 aa  414  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.92 
 
 		 468 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.43 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.01 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.03 
 
 		 471 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.44 
 
 		 465 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 467 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.49 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.7 
 
 		 465 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  45.55 
 
 		 464 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 		 466 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.05 
 
 		 468 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.24 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.75 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.19 
 
 		 466 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.04 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.04 
 
 		 464 aa  380  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.25 
 
 		 465 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 		 465 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 		 464 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 		 480 aa  377  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.26 
 
 		 464 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 		 466 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.71 
 
 		 480 aa  376  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 		 465 aa  375  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.28 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 463 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.71 
 
 		 471 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 465 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.51 
 
 		 470 aa  374  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0631  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0991753  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0644  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 		 466 aa  374  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.963668 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 468 aa  369  1e-101  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 473 aa  369  1e-101  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 		 460 aa  368  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.35 
 
 		 471 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 		 491 aa  367  1e-100  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 		 477 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.46 
 
 		 466 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 		 465 aa  361  1e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  40.82 
 
 		 468 aa  362  1e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 		 462 aa  362  1e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 		 465 aa  362  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.5 
 
 		 478 aa  359  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 		 473 aa  359  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 		 465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 		 462 aa  355  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 		 471 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 468 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 		 472 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.22 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 		 473 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 		 473 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.03 
 
 		 479 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 		 479 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.7 
 
 		 478 aa  350  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 		 477 aa  350  4e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 		 487 aa  347  3e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 464 aa  347  3e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 		 464 aa  346  4e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.76 
 
 		 487 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 457 aa  345  8e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.76 
 
 		 539 aa  345  8.999999999999999e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0114  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0247817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 469 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 461 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 		 479 aa  344  2e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10469  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.43 
 
 		 464 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 		 478 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 		 477 aa  343  5e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.21 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 		 467 aa  342  7e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.01 
 
 		 466 aa  342  9e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 		 478 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>