More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1610 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  70.82 
 
 		 473 aa  707    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1610  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  959    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.184243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1577  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 473 aa  959    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.63 
 
 		 473 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.84 
 
 		 473 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 		 473 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.95 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.68 
 
 		 473 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 471 aa  381  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 470 aa  347  2e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 		 465 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 		 458 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 459 aa  322  7e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 		 471 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 459 aa  319  7e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 459 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.18 
 
 		 463 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 		 468 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 		 459 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 		 459 aa  316  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 459 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 		 459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.94 
 
 		 465 aa  313  5.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 		 457 aa  311  2e-83  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 466 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.02 
 
 		 471 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 		 459 aa  309  9e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 		 463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  37.45 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 		 468 aa  305  9.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.25 
 
 		 472 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.79 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 		 471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.03 
 
 		 470 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  34.81 
 
 		 459 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.81 
 
 		 465 aa  302  8.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.44 
 
 		 459 aa  302  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.91 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.69 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 		 466 aa  299  9e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.36 
 
 		 466 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.25 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 		 462 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.08 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  37.26 
 
 		 466 aa  297  2e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.88 
 
 		 465 aa  297  3e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.21 
 
 		 468 aa  297  3e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  35.46 
 
 		 464 aa  296  4e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 		 477 aa  296  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.14 
 
 		 469 aa  296  5e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 		 464 aa  294  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 		 467 aa  293  5e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 		 464 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.49 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 		 480 aa  292  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 462 aa  291  1e-77  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.75 
 
 		 466 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.71 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 462 aa  291  2e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.31 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.85 
 
 		 476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 		 477 aa  290  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.92 
 
 		 476 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 		 466 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 		 466 aa  289  6e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.28 
 
 		 466 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.29 
 
 		 467 aa  289  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.44 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 		 468 aa  289  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.44 
 
 		 467 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.13 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.98 
 
 		 476 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.04 
 
 		 471 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.79 
 
 		 463 aa  288  2e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.06 
 
 		 467 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  36 
 
 		 465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>