More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1830 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  68.75 
 
 
459 aa  661    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.93 
 
 
459 aa  662    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.47 
 
 
459 aa  668    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.81 
 
 
459 aa  646    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
466 aa  944    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.68 
 
 
462 aa  621  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.82 
 
 
481 aa  615  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.83 
 
 
461 aa  609  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.16 
 
 
477 aa  605  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.25 
 
 
460 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.45 
 
 
459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.5 
 
 
459 aa  600  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
458 aa  598  1e-170  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.42 
 
 
461 aa  595  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.15 
 
 
456 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.13 
 
 
461 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.91 
 
 
460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.05 
 
 
463 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.72 
 
 
457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.57 
 
 
460 aa  552  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.75 
 
 
458 aa  549  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.26 
 
 
458 aa  549  1e-155  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.66 
 
 
460 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.78 
 
 
460 aa  549  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
455 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
455 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
455 aa  535  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 
459 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.18 
 
 
467 aa  507  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.78 
 
 
469 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.74 
 
 
466 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 
473 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
465 aa  359  5e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.61 
 
 
470 aa  349  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
471 aa  345  7e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.16 
 
 
473 aa  345  8e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 
463 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
473 aa  343  5e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
473 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
473 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
468 aa  342  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  40.86 
 
 
464 aa  341  1e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
471 aa  333  4e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
467 aa  330  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.05 
 
 
471 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.71 
 
 
471 aa  325  8.000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
467 aa  322  6e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
470 aa  322  7e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
464 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
462 aa  320  3e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
467 aa  319  6e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.33 
 
 
481 aa  318  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 
480 aa  315  8e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
469 aa  313  3.9999999999999997e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 
467 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.25 
 
 
468 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 
470 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.75 
 
 
467 aa  311  1e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.17 
 
 
458 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
462 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 
465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.17 
 
 
467 aa  310  5e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.67 
 
 
459 aa  309  5.9999999999999995e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  9e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  9e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  9e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.95 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.76 
 
 
465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.578679  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.63 
 
 
470 aa  307  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.15 
 
 
462 aa  305  8.000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.4 
 
 
581 aa  304  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.64 
 
 
468 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.69 
 
 
463 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 
466 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.81 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
470 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 
463 aa  302  7.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>