More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0717 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  902    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 
466 aa  392  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
459 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.1 
 
 
466 aa  369  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  43.91 
 
 
459 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 
458 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.41 
 
 
463 aa  361  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.92 
 
 
459 aa  353  4e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.26 
 
 
459 aa  350  4e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.73 
 
 
461 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.15 
 
 
459 aa  343  5e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.52 
 
 
459 aa  338  9e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
473 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 
470 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.25 
 
 
460 aa  336  5e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.47 
 
 
471 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.64 
 
 
477 aa  335  1e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.28 
 
 
473 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.84 
 
 
458 aa  326  5e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.32 
 
 
460 aa  326  6e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.17 
 
 
459 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
458 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
463 aa  323  5e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.79 
 
 
462 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.01 
 
 
461 aa  322  9.999999999999999e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.36 
 
 
465 aa  318  9e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 
481 aa  318  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.25 
 
 
461 aa  316  4e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
480 aa  315  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
473 aa  315  8e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
460 aa  315  8e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.09 
 
 
458 aa  315  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.87 
 
 
473 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
458 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.07 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
473 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
470 aa  311  1e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.95 
 
 
473 aa  311  1e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.87 
 
 
473 aa  311  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.64 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.21 
 
 
476 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
476 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  310  4e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
476 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.49 
 
 
471 aa  309  6.999999999999999e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
459 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
476 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 
476 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
455 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.79 
 
 
476 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
478 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
468 aa  306  6e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
475 aa  306  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.48 
 
 
478 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
496 aa  306  7e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
471 aa  306  7e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  37.61 
 
 
462 aa  306  7e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 
476 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
478 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.08 
 
 
476 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.07 
 
 
478 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.98 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.98 
 
 
459 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29750  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.49 
 
 
477 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.913625  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.71 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.02 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 
476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.02 
 
 
478 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.14 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.63 
 
 
478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.85 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1140  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 
475 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159732  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
465 aa  302  7.000000000000001e-81  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 
471 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1264  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 
472 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.71337  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
459 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
460 aa  302  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
474 aa  302  9e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 
478 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 
478 aa  301  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.4 
 
 
478 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>