More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2304 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.82 
 
 
481 aa  682    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.11 
 
 
461 aa  649    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.27 
 
 
477 aa  643    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.9 
 
 
461 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.02 
 
 
462 aa  672    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  912    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.05 
 
 
456 aa  632  1e-180  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.9 
 
 
461 aa  625  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.5 
 
 
460 aa  625  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.5 
 
 
466 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.59 
 
 
459 aa  620  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.36 
 
 
459 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.18 
 
 
457 aa  605  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.47 
 
 
459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  64.21 
 
 
459 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.17 
 
 
460 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.33 
 
 
459 aa  598  1e-170  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.43 
 
 
460 aa  596  1e-169  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.92 
 
 
460 aa  591  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.54 
 
 
458 aa  589  1e-167  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.89 
 
 
458 aa  587  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.41 
 
 
458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.02 
 
 
455 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.02 
 
 
455 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.02 
 
 
455 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.2 
 
 
460 aa  557  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.36 
 
 
463 aa  541  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.71 
 
 
469 aa  540  9.999999999999999e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.39 
 
 
459 aa  541  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.39 
 
 
467 aa  508  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 
465 aa  350  3e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
470 aa  343  5e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
471 aa  339  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
473 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.52 
 
 
464 aa  330  3e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 
465 aa  326  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
463 aa  325  1e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
463 aa  324  2e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 
471 aa  323  5e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
468 aa  320  3e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.98 
 
 
473 aa  320  3e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 
465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.6 
 
 
471 aa  319  5e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
465 aa  319  6e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
477 aa  319  7e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
473 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 
459 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
467 aa  317  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
467 aa  317  3e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.36 
 
 
581 aa  317  4e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
473 aa  317  4e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
473 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.23 
 
 
467 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
472 aa  315  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
473 aa  316  7e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.34 
 
 
469 aa  315  8e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
473 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 
467 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
463 aa  312  9e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
462 aa  311  2e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
464 aa  310  2e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
465 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 
468 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 
466 aa  310  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.14 
 
 
467 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.37 
 
 
481 aa  310  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.37 
 
 
473 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
467 aa  310  4e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
467 aa  310  5e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 
473 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
464 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.8 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.08 
 
 
473 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
471 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
465 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
470 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
463 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
470 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.91 
 
 
462 aa  306  5.0000000000000004e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
473 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
466 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.16 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 
470 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.8 
 
 
477 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.31 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 
470 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>