More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3319 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.82 
 
 
466 aa  635    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.94 
 
 
461 aa  698    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.99 
 
 
456 aa  637    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.62 
 
 
461 aa  663    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  969    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  94.81 
 
 
462 aa  860    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.09 
 
 
477 aa  642    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.82 
 
 
459 aa  678    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.82 
 
 
461 aa  631  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.07 
 
 
459 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.9 
 
 
459 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.04 
 
 
460 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
459 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
460 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.3 
 
 
460 aa  601  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 
459 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.3 
 
 
457 aa  592  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.15 
 
 
455 aa  591  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.15 
 
 
455 aa  591  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.15 
 
 
455 aa  591  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  64.32 
 
 
459 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 
458 aa  591  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.65 
 
 
458 aa  587  1e-166  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.01 
 
 
458 aa  580  1e-164  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.23 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.08 
 
 
459 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.11 
 
 
469 aa  541  1e-153  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.98 
 
 
460 aa  527  1e-148  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.35 
 
 
463 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.36 
 
 
467 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
473 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
471 aa  354  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.07 
 
 
473 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
470 aa  342  8e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
463 aa  342  1e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.97 
 
 
473 aa  341  2e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 
473 aa  340  4e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.55 
 
 
473 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 
473 aa  340  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.76 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 
466 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 
465 aa  336  5e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.87 
 
 
464 aa  333  4e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 
468 aa  329  8e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.58 
 
 
471 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
465 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 
465 aa  325  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.86 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.32 
 
 
471 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 
470 aa  318  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.89 
 
 
459 aa  316  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
470 aa  315  8e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
470 aa  315  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
470 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
462 aa  313  3.9999999999999997e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 
581 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.6 
 
 
471 aa  313  5.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
470 aa  311  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
467 aa  311  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 
472 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
463 aa  308  2.0000000000000002e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
470 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
465 aa  306  8.000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
463 aa  306  8.000000000000001e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.92 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
462 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.25 
 
 
458 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
470 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.96 
 
 
462 aa  305  2.0000000000000002e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
468 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
468 aa  303  5.000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.66 
 
 
476 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 
467 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
461 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
468 aa  301  2e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
464 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 
473 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.28 
 
 
468 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 
465 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 
473 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>