More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1863 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.7 
 
 		 461 aa  646    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.97 
 
 		 477 aa  645    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  913    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.93 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 		 461 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.3 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.3 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.3 
 
 		 455 aa  606  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.56 
 
 		 462 aa  595  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.57 
 
 		 456 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.34 
 
 		 481 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.71 
 
 		 459 aa  589  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.58 
 
 		 461 aa  581  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.3 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.72 
 
 		 458 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.52 
 
 		 460 aa  577  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.78 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.39 
 
 		 459 aa  560  1e-158  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.38 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.16 
 
 		 460 aa  555  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.45 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.9 
 
 		 459 aa  557  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.05 
 
 		 457 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  61.57 
 
 		 459 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.18 
 
 		 459 aa  530  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.07 
 
 		 459 aa  525  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.01 
 
 		 458 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.5 
 
 		 460 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.87 
 
 		 467 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.65 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 		 470 aa  346  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 471 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 		 473 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.58 
 
 		 473 aa  326  6e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 		 473 aa  323  3e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 473 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 		 466 aa  323  4e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 473 aa  323  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.06 
 
 		 473 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 		 463 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 		 467 aa  311  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 		 468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 		 463 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.69 
 
 		 467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 		 468 aa  308  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  39.13 
 
 		 464 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.44 
 
 		 471 aa  306  4.0000000000000004e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 		 469 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 		 467 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 467 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 		 465 aa  305  8.000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.61 
 
 		 480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.25 
 
 		 461 aa  302  7.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 		 466 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 		 465 aa  300  5e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 		 464 aa  299  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  299  8e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 		 470 aa  298  1e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  298  2e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 458 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 471 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 581 aa  297  3e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.34 
 
 		 481 aa  297  3e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  297  3e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 470 aa  296  5e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 466 aa  295  9e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 471 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.85 
 
 		 465 aa  295  2e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.36 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.09 
 
 		 466 aa  293  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.63 
 
 		 465 aa  293  6e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 		 476 aa  292  8e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.39 
 
 		 462 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.29 
 
 		 476 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.55 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.1 
 
 		 465 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>