More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4200 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.81 
 
 
461 aa  657    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.92 
 
 
461 aa  645    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
455 aa  916    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
455 aa  916    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
455 aa  916    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.04 
 
 
460 aa  625  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.7 
 
 
477 aa  620  1e-176  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.78 
 
 
460 aa  607  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.56 
 
 
460 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.15 
 
 
462 aa  592  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.15 
 
 
481 aa  593  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.36 
 
 
461 aa  584  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.04 
 
 
456 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.02 
 
 
459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.04 
 
 
457 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.64 
 
 
458 aa  559  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.06 
 
 
459 aa  556  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.3 
 
 
469 aa  556  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
466 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.15 
 
 
459 aa  549  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  60.66 
 
 
459 aa  549  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 
458 aa  546  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.19 
 
 
467 aa  539  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 
458 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.31 
 
 
459 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.03 
 
 
459 aa  530  1e-149  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 
459 aa  527  1e-148  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.94 
 
 
460 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.42 
 
 
460 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.48 
 
 
463 aa  464  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.52 
 
 
471 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
465 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.85 
 
 
473 aa  329  6e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.13 
 
 
473 aa  328  9e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
473 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
473 aa  326  7e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
473 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.49 
 
 
473 aa  324  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
470 aa  319  6e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.26 
 
 
458 aa  316  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 
466 aa  315  8e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
470 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 
462 aa  312  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
458 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.18 
 
 
465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
471 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
470 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.14 
 
 
464 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
474 aa  301  2e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.31 
 
 
465 aa  301  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  37.17 
 
 
464 aa  300  4e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 
468 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 
462 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.91 
 
 
470 aa  297  2e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.76 
 
 
462 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.1 
 
 
466 aa  296  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.96 
 
 
462 aa  296  7e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.3 
 
 
470 aa  295  8e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 
468 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
464 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.34 
 
 
470 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.53 
 
 
467 aa  293  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  292  8e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.13 
 
 
470 aa  292  8e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
467 aa  292  9e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 
465 aa  292  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.39 
 
 
471 aa  291  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4074  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.89 
 
 
461 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000295431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
457 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
462 aa  291  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.74 
 
 
467 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.01 
 
 
467 aa  290  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
457 aa  290  5.0000000000000004e-77  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
463 aa  287  2e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 
462 aa  288  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
471 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 
462 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.85 
 
 
466 aa  286  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
468 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.46 
 
 
468 aa  286  4e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.06 
 
 
480 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
463 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.68 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>