More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3092 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  72.94 
 
 
459 aa  679    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.78 
 
 
459 aa  637    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
463 aa  909    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.46 
 
 
459 aa  689    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  73 
 
 
459 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.05 
 
 
458 aa  619  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.05 
 
 
466 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.61 
 
 
459 aa  589  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.43 
 
 
460 aa  576  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.36 
 
 
460 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.35 
 
 
461 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.36 
 
 
459 aa  538  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 
461 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.35 
 
 
481 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.22 
 
 
462 aa  521  1e-146  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.23 
 
 
461 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.68 
 
 
477 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.56 
 
 
456 aa  508  1e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.19 
 
 
460 aa  505  9.999999999999999e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.75 
 
 
457 aa  486  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.85 
 
 
460 aa  483  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.07 
 
 
460 aa  478  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.1 
 
 
458 aa  476  1e-133  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.6 
 
 
458 aa  475  1e-133  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.8 
 
 
455 aa  461  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.5 
 
 
469 aa  439  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.55 
 
 
459 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.59 
 
 
467 aa  424  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 
470 aa  378  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
465 aa  355  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  40.22 
 
 
464 aa  345  8e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
467 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
473 aa  340  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
465 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
465 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 
471 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  336  5.999999999999999e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.08 
 
 
463 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
473 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.81 
 
 
466 aa  335  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
467 aa  334  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
473 aa  333  3e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.55 
 
 
473 aa  333  3e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 
462 aa  333  4e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
473 aa  333  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.29 
 
 
467 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 
464 aa  333  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  332  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 
463 aa  331  2e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.3 
 
 
471 aa  330  3e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
471 aa  329  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
467 aa  329  6e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
465 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 
468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
471 aa  327  3e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
462 aa  324  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.66 
 
 
473 aa  323  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
466 aa  322  7e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
468 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 
465 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.1 
 
 
466 aa  319  6e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.89 
 
 
459 aa  318  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.77 
 
 
467 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.05 
 
 
464 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
467 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
467 aa  317  3e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
467 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
467 aa  317  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
466 aa  317  4e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 
462 aa  315  9e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  38.96 
 
 
462 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.4 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.19 
 
 
476 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
467 aa  313  2.9999999999999996e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.4 
 
 
476 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
476 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.54 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 
476 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 
476 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
468 aa  313  5.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.84 
 
 
476 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 
464 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
465 aa  312  9e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 
469 aa  311  1e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
476 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 
468 aa  311  2e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>