More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1270 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.95 
 
 
458 aa  682    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.55 
 
 
459 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  913    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.47 
 
 
466 aa  668    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.81 
 
 
460 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.4 
 
 
459 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.26 
 
 
459 aa  703    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.46 
 
 
463 aa  667    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  79.52 
 
 
459 aa  760    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  65 
 
 
461 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.15 
 
 
461 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.59 
 
 
459 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.17 
 
 
460 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.85 
 
 
477 aa  586  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.73 
 
 
462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
481 aa  581  1e-164  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.15 
 
 
461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.51 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.85 
 
 
456 aa  558  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 
458 aa  553  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.42 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.08 
 
 
460 aa  540  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 
458 aa  535  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.41 
 
 
457 aa  528  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 
455 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 
455 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 
455 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.21 
 
 
459 aa  479  1e-134  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.1 
 
 
469 aa  481  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.52 
 
 
467 aa  461  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
465 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
473 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.55 
 
 
466 aa  375  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 
470 aa  374  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  367  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.66 
 
 
473 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
473 aa  366  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.44 
 
 
473 aa  365  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
473 aa  365  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.23 
 
 
473 aa  364  2e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 
473 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
463 aa  357  2.9999999999999997e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.05 
 
 
463 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
471 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.52 
 
 
471 aa  352  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.47 
 
 
464 aa  350  3e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.76 
 
 
465 aa  344  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.55 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.08 
 
 
467 aa  343  5e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.18 
 
 
462 aa  343  5e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.71 
 
 
471 aa  340  4e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
459 aa  339  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 
462 aa  338  9e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 
467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
465 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
468 aa  335  7.999999999999999e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
467 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
462 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.61 
 
 
464 aa  331  2e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
467 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
581 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
463 aa  328  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 
477 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 
468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
464 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
468 aa  326  6e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
480 aa  326  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.48 
 
 
472 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
466 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 
465 aa  325  1e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
465 aa  324  2e-87  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.9 
 
 
472 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
464 aa  323  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
467 aa  323  6e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.91 
 
 
462 aa  322  8e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
465 aa  322  9.999999999999999e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.4 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.36 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.28 
 
 
480 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.89 
 
 
473 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  37.77 
 
 
462 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
467 aa  320  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.74 
 
 
462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
474 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
467 aa  319  6e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 
469 aa  319  6e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.82 
 
 
458 aa  319  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 
467 aa  319  7e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.78 
 
 
462 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
470 aa  319  7.999999999999999e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
467 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.97 
 
 
480 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
463 aa  318  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>