More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3278 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  958    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.09 
 
 		 481 aa  644    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.74 
 
 		 461 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.27 
 
 		 456 aa  648    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.45 
 
 		 461 aa  643    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.22 
 
 		 461 aa  700    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.43 
 
 		 462 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.67 
 
 		 460 aa  662    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.27 
 
 		 459 aa  642    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.01 
 
 		 460 aa  632  1e-180  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.57 
 
 		 460 aa  625  1e-178  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.16 
 
 		 466 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.7 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.7 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.7 
 
 		 455 aa  621  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.78 
 
 		 458 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.56 
 
 		 459 aa  609  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.85 
 
 		 459 aa  608  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.57 
 
 		 458 aa  606  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.82 
 
 		 457 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 		 459 aa  602  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.94 
 
 		 469 aa  595  1e-169  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  64.3 
 
 		 459 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 		 458 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.25 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.14 
 
 		 460 aa  581  1e-164  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 		 467 aa  569  1e-161  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.08 
 
 		 459 aa  567  1e-160  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.96 
 
 		 460 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.01 
 
 		 463 aa  521  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 		 470 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 		 473 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.13 
 
 		 471 aa  360  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 		 465 aa  359  8e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.83 
 
 		 473 aa  352  8.999999999999999e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 463 aa  349  5e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.84 
 
 		 471 aa  347  4e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.25 
 
 		 473 aa  345  7e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 		 473 aa  345  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 		 473 aa  344  2e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 		 473 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 		 466 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.74 
 
 		 464 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 		 468 aa  338  9.999999999999999e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.32 
 
 		 471 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 		 465 aa  332  7.000000000000001e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 465 aa  329  5.0000000000000004e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 		 465 aa  329  7e-89  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.82 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 468 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 		 470 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  9e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 		 467 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  1e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  2e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 		 470 aa  325  2e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.17 
 
 		 463 aa  322  8e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 		 467 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.65 
 
 		 462 aa  320  3.9999999999999996e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 		 581 aa  319  6e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.6 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.32 
 
 		 470 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 461 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.73 
 
 		 467 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 		 464 aa  317  3e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 463 aa  317  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 		 467 aa  317  4e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.88 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.16 
 
 		 467 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 		 462 aa  316  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.52 
 
 		 467 aa  315  9.999999999999999e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 462 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.33 
 
 		 470 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.45 
 
 		 467 aa  312  9e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 468 aa  312  1e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.51 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.39 
 
 		 464 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 		 480 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>