More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_16340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
458 aa  914    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.78 
 
 
477 aa  638    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.81 
 
 
461 aa  631  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.13 
 
 
460 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.54 
 
 
459 aa  608  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.01 
 
 
481 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.33 
 
 
462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.7 
 
 
461 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.07 
 
 
456 aa  592  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.59 
 
 
458 aa  589  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.75 
 
 
466 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.04 
 
 
461 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.7 
 
 
460 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.76 
 
 
459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.59 
 
 
460 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.28 
 
 
459 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.53 
 
 
459 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  63.4 
 
 
459 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.36 
 
 
458 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 
455 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 
455 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 
455 aa  566  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.78 
 
 
457 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.66 
 
 
459 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.56 
 
 
460 aa  553  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.19 
 
 
469 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.5 
 
 
467 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.09 
 
 
460 aa  514  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.44 
 
 
459 aa  517  1.0000000000000001e-145  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.24 
 
 
463 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 
473 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
473 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
470 aa  356  5e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.17 
 
 
465 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
473 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
473 aa  350  2e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.79 
 
 
473 aa  347  2e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.61 
 
 
463 aa  338  8e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.54 
 
 
466 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 
467 aa  336  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
465 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.87 
 
 
470 aa  333  5e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.7 
 
 
470 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  40.83 
 
 
464 aa  331  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 
461 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.5 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
470 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.47 
 
 
464 aa  326  6e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.140424  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
468 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0745  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
461 aa  324  2e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
471 aa  323  4e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.16 
 
 
468 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 
464 aa  322  7e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
465 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.78 
 
 
467 aa  320  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.92 
 
 
468 aa  320  5e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
470 aa  318  1e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
470 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.82 
 
 
471 aa  316  6e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  316  7e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  316  7e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
470 aa  316  7e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 
470 aa  316  7e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 
463 aa  315  9e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0616  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 
466 aa  315  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
462 aa  311  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
465 aa  311  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.7 
 
 
465 aa  311  2e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
465 aa  311  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.06 
 
 
458 aa  311  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 
468 aa  309  5.9999999999999995e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 
472 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2479  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
467 aa  308  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.92 
 
 
473 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 
473 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.29 
 
 
473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.63 
 
 
466 aa  304  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.64 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.64 
 
 
468 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 
459 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3518  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 
467 aa  303  5.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
464 aa  302  6.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>