More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10500 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.82 
 
 
477 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
457 aa  917    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.9 
 
 
456 aa  717    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.74 
 
 
461 aa  643    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.18 
 
 
459 aa  634    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.26 
 
 
461 aa  628  1e-179  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  70.64 
 
 
462 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.3 
 
 
481 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.05 
 
 
458 aa  624  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.09 
 
 
459 aa  622  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.41 
 
 
461 aa  617  1e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.72 
 
 
466 aa  612  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.26 
 
 
459 aa  611  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.41 
 
 
460 aa  604  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.04 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.04 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.04 
 
 
455 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
459 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.81 
 
 
460 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.41 
 
 
459 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.88 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  62.97 
 
 
459 aa  575  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.78 
 
 
458 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.22 
 
 
460 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.75 
 
 
458 aa  560  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.7 
 
 
460 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.45 
 
 
469 aa  530  1e-149  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.22 
 
 
463 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.9 
 
 
467 aa  513  1e-144  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.93 
 
 
459 aa  511  1e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.43 
 
 
473 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.01 
 
 
465 aa  335  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 
471 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
473 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
470 aa  330  4e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
473 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.55 
 
 
473 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.3 
 
 
468 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
473 aa  326  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.3 
 
 
463 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
473 aa  326  5e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  40 
 
 
464 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
463 aa  318  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  2e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.48 
 
 
470 aa  317  2e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
581 aa  317  2e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
470 aa  317  3e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.77 
 
 
470 aa  317  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
471 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 
466 aa  316  5e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
465 aa  315  9.999999999999999e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
470 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.99 
 
 
465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.42 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
470 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
474 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.38 
 
 
467 aa  310  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
462 aa  309  5.9999999999999995e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.31 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.67 
 
 
467 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.05 
 
 
459 aa  307  3e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 
458 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
468 aa  306  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
463 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.24 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.37 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
467 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 
466 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.1 
 
 
465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.35 
 
 
463 aa  303  4.0000000000000003e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.81 
 
 
467 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
476 aa  302  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 
476 aa  302  9e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
471 aa  301  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.79 
 
 
480 aa  301  1e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
467 aa  301  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
468 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.5 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 
468 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>