More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2645 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  100 
 
 
459 aa  916    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.2 
 
 
458 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.98 
 
 
459 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.94 
 
 
463 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.52 
 
 
459 aa  760    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.14 
 
 
459 aa  669    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.75 
 
 
466 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.56 
 
 
459 aa  620  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.84 
 
 
460 aa  602  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.26 
 
 
461 aa  597  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.44 
 
 
461 aa  580  1e-164  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.21 
 
 
459 aa  578  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.32 
 
 
481 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.43 
 
 
460 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.3 
 
 
477 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.99 
 
 
462 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.85 
 
 
456 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.91 
 
 
460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.12 
 
 
461 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.4 
 
 
458 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 
458 aa  532  1e-150  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.66 
 
 
455 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.66 
 
 
455 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.66 
 
 
455 aa  528  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.31 
 
 
460 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.75 
 
 
460 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.97 
 
 
457 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.57 
 
 
469 aa  479  1e-134  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  54.55 
 
 
459 aa  471  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.73 
 
 
467 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.12 
 
 
466 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.09 
 
 
470 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.94 
 
 
465 aa  361  1e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.59 
 
 
473 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.87 
 
 
473 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  353  5e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
473 aa  352  8e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.49 
 
 
471 aa  352  8e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.02 
 
 
473 aa  352  8.999999999999999e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
473 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 
473 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.16 
 
 
473 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
463 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.97 
 
 
465 aa  339  5e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.95 
 
 
471 aa  333  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.59 
 
 
471 aa  330  4e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  38.79 
 
 
464 aa  326  5e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.17 
 
 
471 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.04 
 
 
468 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.43 
 
 
462 aa  323  5e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
467 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.94 
 
 
463 aa  320  1.9999999999999998e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.97 
 
 
465 aa  318  1e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.84 
 
 
468 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
467 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
462 aa  315  7e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.31 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.52 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.35 
 
 
467 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
467 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 
463 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.94 
 
 
458 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.71 
 
 
467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.91 
 
 
459 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.24 
 
 
462 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.66 
 
 
468 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.88 
 
 
464 aa  306  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.44 
 
 
466 aa  305  9.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 
476 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 
466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.58 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.28 
 
 
458 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.53 
 
 
476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 
459 aa  303  5.000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.6 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
462 aa  302  7.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.06 
 
 
480 aa  302  8.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
472 aa  302  9e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
476 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.61 
 
 
476 aa  302  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
476 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>