More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4108 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  935    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.55 
 
 		 459 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.48 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  47.12 
 
 		 459 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.16 
 
 		 458 aa  375  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.59 
 
 		 459 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.64 
 
 		 461 aa  372  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.2 
 
 		 459 aa  366  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.34 
 
 		 459 aa  363  3e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.36 
 
 		 459 aa  355  8.999999999999999e-97  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 		 477 aa  353  5e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 		 461 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 481 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.93 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 		 460 aa  346  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.61 
 
 		 462 aa  345  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.6 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.34 
 
 		 473 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.66 
 
 		 461 aa  336  5e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.54 
 
 		 458 aa  328  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 		 473 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 		 470 aa  327  3e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.8 
 
 		 460 aa  326  5e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 460 aa  325  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 		 460 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.99 
 
 		 471 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 		 455 aa  321  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 		 473 aa  319  7e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 473 aa  316  5e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 		 456 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.67 
 
 		 473 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.15 
 
 		 463 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.46 
 
 		 473 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 471 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.68 
 
 		 465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 		 464 aa  313  3.9999999999999997e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.74 
 
 		 471 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 458 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 		 465 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 		 466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.37 
 
 		 464 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 487 aa  303  6.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.51 
 
 		 463 aa  302  7.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 		 467 aa  302  8.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 		 471 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.8 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.54 
 
 		 470 aa  300  5e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 465 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2542  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 		 474 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.167426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  40 
 
 		 478 aa  299  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.22 
 
 		 476 aa  298  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 		 459 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.61 
 
 		 465 aa  296  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.56 
 
 		 457 aa  296  7e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0113  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.32 
 
 		 480 aa  296  8e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.335173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.76 
 
 		 467 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.43 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.6 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0768  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.28 
 
 		 457 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533222  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.22335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  36.13 
 
 		 462 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.27 
 
 		 464 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.79 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.79 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.02 
 
 		 476 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.79 
 
 		 478 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.76 
 
 		 470 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  3e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 		 467 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.06 
 
 		 487 aa  293  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.33 
 
 		 480 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 478 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 478 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.54 
 
 		 470 aa  293  5e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.03 
 
 		 470 aa  293  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01196  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.71 
 
 		 478 aa  293  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.738792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.59 
 
 		 476 aa  293  6e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.58 
 
 		 478 aa  293  7e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>