More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1865 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.12 
 
 		 456 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 458 aa  920    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.03 
 
 		 461 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.23 
 
 		 460 aa  615  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.03 
 
 		 461 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.57 
 
 		 477 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.05 
 
 		 457 aa  587  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.73 
 
 		 462 aa  587  1e-166  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.65 
 
 		 481 aa  587  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.98 
 
 		 460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.61 
 
 		 461 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.41 
 
 		 459 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.76 
 
 		 460 aa  579  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.8 
 
 		 459 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.16 
 
 		 459 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.26 
 
 		 466 aa  570  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.59 
 
 		 458 aa  568  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.64 
 
 		 455 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.64 
 
 		 455 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.64 
 
 		 455 aa  558  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  62.25 
 
 		 459 aa  555  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.61 
 
 		 459 aa  554  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.68 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.93 
 
 		 459 aa  537  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.47 
 
 		 459 aa  535  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.89 
 
 		 460 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.7 
 
 		 469 aa  512  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.17 
 
 		 467 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.58 
 
 		 460 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.28 
 
 		 463 aa  478  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 		 465 aa  320  3.9999999999999996e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.41 
 
 		 470 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  39.66 
 
 		 464 aa  306  6e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 		 466 aa  302  7.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.45 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.51 
 
 		 473 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.59 
 
 		 468 aa  300  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 473 aa  299  7e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 473 aa  298  9e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.3 
 
 		 473 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.74 
 
 		 470 aa  296  7e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 		 473 aa  296  7e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.72 
 
 		 473 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 		 463 aa  290  3e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.47 
 
 		 465 aa  290  3e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 		 471 aa  290  3e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.6 
 
 		 463 aa  290  4e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.82 
 
 		 463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.22 
 
 		 469 aa  288  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.04 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.75 
 
 		 474 aa  287  2e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.88 
 
 		 470 aa  288  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.22 
 
 		 471 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 470 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.48 
 
 		 467 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.31 
 
 		 466 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.39 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.74 
 
 		 467 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 462 aa  283  4.0000000000000003e-75  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.38 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.15 
 
 		 467 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.45 
 
 		 467 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.74 
 
 		 472 aa  281  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 467 aa  280  4e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  38.89 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.42 
 
 		 466 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.8 
 
 		 459 aa  279  6e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 		 470 aa  280  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.27 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.69 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 		 466 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.09 
 
 		 469 aa  277  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.72 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.96 
 
 		 462 aa  277  3e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.05 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.1 
 
 		 481 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.58 
 
 		 480 aa  276  5e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.53 
 
 		 465 aa  276  7e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 		 471 aa  275  9e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.71 
 
 		 476 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>