More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0944 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0944  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
458 aa  912    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0941075  normal  0.125714 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.95 
 
 
459 aa  705    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.08 
 
 
459 aa  726    Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  73.2 
 
 
459 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0936  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.83 
 
 
459 aa  650    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.05659  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3134  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.21 
 
 
460 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.011293  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3092  dihydrolipoamide dehydrogenase  69.05 
 
 
463 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1830  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.52 
 
 
466 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803775  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.67 
 
 
461 aa  613  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.34 
 
 
459 aa  608  1e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0595207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4199  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.78 
 
 
461 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0596689  normal  0.0231786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3551  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.11 
 
 
462 aa  599  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.324382  normal  0.104142 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1475  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.53 
 
 
461 aa  597  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.301325  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3319  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.38 
 
 
481 aa  591  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3278  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.74 
 
 
477 aa  582  1.0000000000000001e-165  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.355374  normal  0.178239 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2100  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.81 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.243913  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2304  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.89 
 
 
459 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1351  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.33 
 
 
456 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1780  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.18 
 
 
460 aa  554  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00606157  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16340  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.36 
 
 
458 aa  550  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0637268  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1606  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.19 
 
 
460 aa  549  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137616 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1612  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.08 
 
 
460 aa  551  1e-155  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0020481  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1865  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.68 
 
 
458 aa  546  1e-154  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00112442  decreased coverage  0.000152881 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4469  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 
455 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4300  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 
455 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.943446  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4200  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.67 
 
 
455 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10500  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.75 
 
 
457 aa  529  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.107097  normal  0.115157 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13320  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.22 
 
 
459 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00904125  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1863  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.95 
 
 
469 aa  464  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16430  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.69 
 
 
467 aa  462  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0950556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4108  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.16 
 
 
466 aa  368  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181045  normal  0.0667058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.56 
 
 
465 aa  357  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.86 
 
 
470 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.07 
 
 
473 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.56 
 
 
473 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.27 
 
 
463 aa  345  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.62 
 
 
473 aa  340  4e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
471 aa  339  7e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
473 aa  338  9e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.4 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.19 
 
 
473 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.95 
 
 
473 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  41.52 
 
 
464 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.93 
 
 
471 aa  328  9e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.05 
 
 
462 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.52 
 
 
465 aa  327  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
465 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
468 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.97 
 
 
471 aa  318  9e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.2 
 
 
468 aa  317  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.29 
 
 
467 aa  316  6e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 
467 aa  315  8e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0717  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.35 
 
 
459 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277334  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.13 
 
 
465 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.43 
 
 
463 aa  312  6.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
465 aa  312  7.999999999999999e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.26 
 
 
463 aa  311  2e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.26 
 
 
465 aa  310  4e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
462 aa  309  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.06 
 
 
467 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.3 
 
 
462 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.32 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.13 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.34 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.53 
 
 
476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.65 
 
 
464 aa  303  4.0000000000000003e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.56 
 
 
467 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.83 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.7 
 
 
467 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.62 
 
 
476 aa  302  9e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.77 
 
 
480 aa  302  9e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.96 
 
 
465 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.39 
 
 
464 aa  300  3e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.11 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.19 
 
 
476 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
476 aa  300  4e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.28 
 
 
458 aa  300  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
476 aa  299  9e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.38 
 
 
467 aa  298  1e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.27 
 
 
476 aa  298  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  35.81 
 
 
462 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
466 aa  298  2e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.98 
 
 
476 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>