More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1632 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1632  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
483 aa  972    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.872525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1797  dihydrolipoamide dehydrogenase  67.02 
 
 
474 aa  618  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1494  dihydrolipoamide dehydrogenase  66.6 
 
 
473 aa  590  1e-167  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0784  dihydrolipoamide dehydrogenase  64.98 
 
 
472 aa  556  1e-157  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.25 
 
 
469 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.08 
 
 
469 aa  508  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1972  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.44 
 
 
474 aa  382  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.76 
 
 
473 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.92 
 
 
473 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.2 
 
 
473 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1813  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.82 
 
 
477 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0853723  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.78 
 
 
468 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
465 aa  375  1e-102  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.53 
 
 
479 aa  373  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0279881  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.57 
 
 
468 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 
479 aa  371  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.75 
 
 
478 aa  372  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.67 
 
 
473 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.9 
 
 
478 aa  370  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.12 
 
 
465 aa  369  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.61 
 
 
480 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.45 
 
 
472 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3018  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 
479 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.340958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.86 
 
 
462 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.68 
 
 
479 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.09 
 
 
465 aa  364  2e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.33 
 
 
462 aa  364  2e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
466 aa  363  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.77 
 
 
482 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.35 
 
 
463 aa  363  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  43.76 
 
 
464 aa  362  1e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.18 
 
 
481 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.98 
 
 
465 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
464 aa  361  2e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.32 
 
 
465 aa  360  2e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.46 
 
 
465 aa  360  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.19 
 
 
462 aa  360  3e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.81 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.72 
 
 
477 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2063  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.53 
 
 
487 aa  356  5e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3894  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.69 
 
 
471 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_004310  BR1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
487 aa  356  5.999999999999999e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.91 
 
 
464 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.52 
 
 
466 aa  355  7.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1084  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.74 
 
 
539 aa  354  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.27 
 
 
481 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
465 aa  353  4e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
480 aa  353  4e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.54 
 
 
481 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.95 
 
 
486 aa  351  2e-95  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.206341  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1425  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.83 
 
 
466 aa  350  3e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.197772  hitchhiker  0.000000283985 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
464 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1626  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.17 
 
 
487 aa  348  1e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  40.71 
 
 
457 aa  348  2e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.24 
 
 
468 aa  347  2e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2823  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.99 
 
 
465 aa  347  4e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
466 aa  345  1e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0435  hypothetical protein  41.61 
 
 
478 aa  342  7e-93  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0273668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.23 
 
 
470 aa  342  9e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 
470 aa  342  1e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.51 
 
 
469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.850345  decreased coverage  0.00227015 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.57 
 
 
473 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.29 
 
 
468 aa  334  2e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.9 
 
 
491 aa  330  4e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3003  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.83 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
473 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.43 
 
 
473 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2306  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.3 
 
 
473 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.21 
 
 
473 aa  325  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  41 
 
 
473 aa  323  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2779  dihydrolipoamide dehydrogenase E3 component of 3 enzyme complexes  37.47 
 
 
463 aa  323  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.285583  normal  0.562583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3815  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.99 
 
 
468 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.585527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11020  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.31 
 
 
465 aa  321  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.874516 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.47 
 
 
463 aa  320  3e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2104  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.11 
 
 
471 aa  319  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0884852  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.38 
 
 
457 aa  319  7e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.01 
 
 
463 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2712  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 
465 aa  317  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.822199  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.44 
 
 
459 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.39 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0853  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.27 
 
 
465 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50611  normal  0.0780472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.1 
 
 
470 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
471 aa  311  2e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1689  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.56 
 
 
462 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.08159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.87 
 
 
459 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  39.96 
 
 
585 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6148  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.55 
 
 
461 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0268459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4304  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.9 
 
 
471 aa  309  6.999999999999999e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.16 
 
 
467 aa  309  9e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
459 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.63 
 
 
459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0624  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.44 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal  0.337004 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>