More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1104 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.14 
 
 		 466 aa  755    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.14 
 
 		 466 aa  756    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 466 aa  941    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  78.71 
 
 		 466 aa  761    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  80.22 
 
 		 466 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  79.57 
 
 		 466 aa  760    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0235  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.53 
 
 		 466 aa  695    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.982675  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  77.42 
 
 		 467 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  68.88 
 
 		 466 aa  631  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.7 
 
 		 467 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.48 
 
 		 467 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  63.04 
 
 		 467 aa  570  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0537  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.82 
 
 		 480 aa  568  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.04 
 
 		 467 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0425  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.39 
 
 		 467 aa  561  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0159  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.39 
 
 		 467 aa  558  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.659898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0183  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.17 
 
 		 467 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.7 
 
 		 469 aa  553  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.74 
 
 		 467 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.66 
 
 		 466 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0274  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.499041  normal  0.530597 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.01 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0180  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.3 
 
 		 467 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.09 
 
 		 463 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0550  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.87 
 
 		 467 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00865571  normal  0.262982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.66 
 
 		 466 aa  543  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.13 
 
 		 581 aa  535  1e-151  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1296  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.41 
 
 		 463 aa  532  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2225  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.01 
 
 		 465 aa  534  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.325958  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.01 
 
 		 471 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.08 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.64 
 
 		 467 aa  522  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.86 
 
 		 462 aa  521  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.79 
 
 		 465 aa  523  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.52 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.17 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.52 
 
 		 468 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0551  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.7 
 
 		 464 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.08 
 
 		 468 aa  513  1e-144  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.76 
 
 		 470 aa  513  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.73 
 
 		 462 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1215  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.17 
 
 		 466 aa  508  1e-143  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00663567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.52 
 
 		 462 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3964  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.99 
 
 		 468 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.8 
 
 		 466 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.349518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.77 
 
 		 468 aa  504  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  55.1 
 
 		 500 aa  504  1e-141  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.21 
 
 		 462 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05840  dihydrolipoyl dehydrogenase, putative  55.7 
 
 		 511 aa  498  1e-139  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.465888  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3400  dihydrolipoamide dehydrogenase  55.87 
 
 		 470 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.131603  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2886  dihydrolipoyl dehydrogenase  55.84 
 
 		 464 aa  484  1e-135  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945112  normal  0.240271 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26614  predicted protein  55.48 
 
 		 504 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0261513  normal  0.318168 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.54 
 
 		 468 aa  454  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.92 
 
 		 474 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  51.39 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.93 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.341599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4216  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 598 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0718  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 470 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21952e-17 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.75 
 
 		 476 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  50.55 
 
 		 466 aa  440  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4996  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.49 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.43 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.68 
 
 		 476 aa  435  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.67 
 
 		 467 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.53 
 
 		 478 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 		 476 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.03 
 
 		 470 aa  434  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.73 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1642  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.11 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.370947  normal  0.099089 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.32 
 
 		 478 aa  435  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1432  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.31 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21637  normal  0.141964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1392  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1486  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.1 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.975022  hitchhiker  0.00623097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.52 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  47.84 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3309  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.21 
 
 		 462 aa  431  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.900179  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1510  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.1 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.647996  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1030  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.1 
 
 		 476 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.784148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.76 
 
 		 480 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.354559  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.89 
 
 		 476 aa  428  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2764  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.54 
 
 		 477 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.87 
 
 		 478 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0582  putative dihydrolipoamide dehydrogenase  48.41 
 
 		 474 aa  428  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.385842 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.24 
 
 		 462 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.59 
 
 		 466 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1276  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36951  FAD flavoprotein  52.94 
 
 		 477 aa  424  1e-117  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.378562 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2446  2-oxoglutarate dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  46.71 
 
 		 472 aa  420  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0751  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  51.2 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.39 
 
 		 478 aa  418  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  50.98 
 
 		 460 aa  421  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1611  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.96 
 
 		 483 aa  420  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  48.18 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.07 
 
 		 478 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>