More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1805 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
616 aa  1209    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.54 
 
 
492 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.08 
 
 
491 aa  563  1.0000000000000001e-159  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.86 
 
 
475 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0985  dihydrolipoamide dehydrogenase  62.05 
 
 
472 aa  541  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.747719 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4147  dihydrolipoamide dehydrogenase  53.98 
 
 
469 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.515477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.38 
 
 
470 aa  439  9.999999999999999e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.57 
 
 
470 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.83 
 
 
470 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.3 
 
 
468 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.73 
 
 
468 aa  415  1e-114  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.3 
 
 
468 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.4 
 
 
484 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.4 
 
 
484 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  48.83 
 
 
484 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  395  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
470 aa  393  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  46 
 
 
470 aa  395  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  394  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0353  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.95 
 
 
594 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.308322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.36 
 
 
470 aa  394  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.61 
 
 
475 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 
481 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
465 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
465 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2829  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.12 
 
 
464 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1241  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.07 
 
 
599 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.7 
 
 
472 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1126  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.47 
 
 
463 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2991  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.61 
 
 
464 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1137  dihydrolipoamide dehydrogenase  46.25 
 
 
463 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.249929  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2393  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.77 
 
 
459 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110453  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.16 
 
 
607 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1003  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.6 
 
 
594 aa  368  1e-100  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.851611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.1 
 
 
619 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.98 
 
 
467 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2454  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.2 
 
 
579 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2965  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.37 
 
 
680 aa  369  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35490  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.11 
 
 
464 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0176  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
475 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0168  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.928694  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0126  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 
495 aa  365  1e-99  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0662  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.7 
 
 
474 aa  365  1e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.42488  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6299  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.1 
 
 
625 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0179219 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0123  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.75 
 
 
495 aa  365  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00461139  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0765  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
463 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1246  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
463 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.873311  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00115  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3486  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0173  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4363  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.4 
 
 
463 aa  365  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0167  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  364  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735558  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0120  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0447957  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0118  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00709642  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3543  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.399649  normal  0.262226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0109  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  365  2e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.809196  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0709  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.89 
 
 
476 aa  364  3e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.732763 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.89 
 
 
602 aa  363  5.0000000000000005e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3554  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.14 
 
 
464 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.09 
 
 
452 aa  363  5.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.18 
 
 
463 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.04 
 
 
462 aa  362  9e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0377  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.6 
 
 
476 aa  362  1e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349282 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1093  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.26 
 
 
474 aa  361  2e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.136846  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0676  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.04 
 
 
474 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3566  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.26 
 
 
474 aa  360  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2076  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.08 
 
 
588 aa  360  5e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1459  lipoamide dehydrogenase  43.14 
 
 
474 aa  360  6e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4009  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.26 
 
 
474 aa  359  8e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413471  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3489  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.71639  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1524  lipoamide dehydrogenase  42.92 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1031  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3854  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.94 
 
 
475 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.075768  hitchhiker  0.000000345632 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3360  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.48 
 
 
474 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.91 
 
 
463 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3775  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4192  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.86 
 
 
481 aa  357  5e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3911  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.7 
 
 
475 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000450783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0331  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.96 
 
 
473 aa  356  5.999999999999999e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2623  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.64 
 
 
475 aa  356  6.999999999999999e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.798797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1988  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.93 
 
 
475 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002552  dihydrolipoamide dehydrogenase of pyruvate dehydrogenase complex  42.2 
 
 
475 aa  355  1e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0527  dihydrolipoamide dehydrogenase  44.81 
 
 
464 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3932  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.72 
 
 
475 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000133391  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4052  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.48 
 
 
475 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00676379  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0636  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
474 aa  355  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3752  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.59 
 
 
474 aa  355  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.361486  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  42.22 
 
 
496 aa  353  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.74 
 
 
603 aa  352  8.999999999999999e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3381  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.05 
 
 
476 aa  352  1e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000696126  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0433  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.15 
 
 
475 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000206937 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3597  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.5 
 
 
475 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000546829  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0428  dihydrolipoamide dehydrogenase  41.5 
 
 
475 aa  352  1e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00251394  normal  0.166632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>