More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1248 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  100 
 
 		 460 aa  940    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  49.89 
 
 		 460 aa  498  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  44.13 
 
 		 455 aa  385  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  44.23 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.79 
 
 		 460 aa  378  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  42.61 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  40.48 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  39.87 
 
 		 459 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  40.61 
 
 		 457 aa  363  4e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  40.82 
 
 		 467 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  39.52 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  39.96 
 
 		 458 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  39.74 
 
 		 458 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  39.65 
 
 		 459 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  39.96 
 
 		 466 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  40.35 
 
 		 461 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  39.65 
 
 		 459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  38.78 
 
 		 459 aa  352  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  39.69 
 
 		 459 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  41.4 
 
 		 464 aa  351  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  38.56 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  38.56 
 
 		 459 aa  351  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  39.69 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  39.69 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  39.69 
 
 		 459 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.12 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  40.95 
 
 		 464 aa  349  7e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  37.69 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  37.69 
 
 		 459 aa  348  1e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  37.83 
 
 		 590 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  37.83 
 
 		 459 aa  348  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  37.83 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  40.35 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.24 
 
 		 466 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  37.77 
 
 		 459 aa  343  4e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  40.39 
 
 		 459 aa  342  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  38.34 
 
 		 459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.28 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  38.13 
 
 		 459 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.83 
 
 		 457 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5924  mercuric reductase  38.43 
 
 		 461 aa  331  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.184883  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 459 aa  325  9e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.18 
 
 		 457 aa  325  9e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 		 459 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  35.31 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5092  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.61 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5184  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.61 
 
 		 454 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.605277  normal  0.0255046 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.65 
 
 		 441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.488111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0336  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.43 
 
 		 441 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.7 
 
 		 459 aa  311  1e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.43 
 
 		 441 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  39.22 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3318  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.22 
 
 		 441 aa  310  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3183  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.09 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0356  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39.22 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.800994 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00260  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  39 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00264  hypothetical protein  39 
 
 		 441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5175  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.89 
 
 		 454 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3460  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.43 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0242  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.66 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.235438  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.27 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.14 
 
 		 469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1554  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  34.42 
 
 		 443 aa  283  5.000000000000001e-75  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.7 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  34.38 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0609  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.39 
 
 		 441 aa  280  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0730  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.39 
 
 		 441 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0725774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.48 
 
 		 546 aa  278  1e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0675  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.17 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.399771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0665  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.17 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0615  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.17 
 
 		 441 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.554301 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0617  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0632  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35 
 
 		 440 aa  274  3e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  34.66 
 
 		 507 aa  271  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.63 
 
 		 451 aa  270  2.9999999999999997e-71  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0588  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 446 aa  270  4e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  34.33 
 
 		 548 aa  268  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.2 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00131568  normal  0.41875 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.68 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  34.45 
 
 		 503 aa  262  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  35.09 
 
 		 446 aa  260  4e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C35  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 449 aa  260  4e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.01 
 
 		 470 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.63 
 
 		 475 aa  259  9e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.63 
 
 		 475 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.91 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  32.45 
 
 		 468 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.74 
 
 		 716 aa  256  7e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.63 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.62 
 
 		 745 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.04 
 
 		 494 aa  254  3e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  34.44 
 
 		 551 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  32.53 
 
 		 767 aa  249  9e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 		 462 aa  249  9e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.9 
 
 		 767 aa  248  2e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  32.53 
 
 		 507 aa  247  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  34.9 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  31.06 
 
 		 484 aa  246  4.9999999999999997e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  32.6 
 
 		 479 aa  246  8e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  32.82 
 
 		 475 aa  245  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>