More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0473 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  92.7 
 
 		 507 aa  926    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  64.37 
 
 		 510 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  100 
 
 		 507 aa  1015    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  66.67 
 
 		 507 aa  676    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  62.22 
 
 		 508 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  62.98 
 
 		 505 aa  591  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  56.78 
 
 		 525 aa  549  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  55.13 
 
 		 510 aa  543  1e-153  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  56.18 
 
 		 513 aa  537  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  53.97 
 
 		 509 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  51.98 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  51.49 
 
 		 515 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  51.98 
 
 		 515 aa  498  1e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  51.43 
 
 		 520 aa  440  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  42.24 
 
 		 532 aa  415  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  42.13 
 
 		 504 aa  394  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  42.83 
 
 		 720 aa  357  3.9999999999999996e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.82 
 
 		 475 aa  356  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.61 
 
 		 475 aa  355  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.05 
 
 		 472 aa  349  8e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.47 
 
 		 713 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.64 
 
 		 473 aa  346  6e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.32 
 
 		 473 aa  345  8e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  40.37 
 
 		 716 aa  345  1e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.33 
 
 		 482 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.87 
 
 		 717 aa  333  4e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  40.04 
 
 		 716 aa  331  2e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  38.27 
 
 		 713 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  40.08 
 
 		 704 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  40.4 
 
 		 714 aa  325  1e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.21 
 
 		 717 aa  325  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  38.74 
 
 		 738 aa  323  4e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.82 
 
 		 746 aa  322  8e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.93 
 
 		 722 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  37.93 
 
 		 717 aa  320  3e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.24 
 
 		 495 aa  320  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  40.04 
 
 		 714 aa  319  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.63 
 
 		 722 aa  319  9e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  41.68 
 
 		 722 aa  317  4e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.47 
 
 		 472 aa  316  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.38 
 
 		 474 aa  315  9.999999999999999e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.46 
 
 		 494 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.5 
 
 		 712 aa  311  2e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.37 
 
 		 475 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.98 
 
 		 488 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.25 
 
 		 471 aa  300  4e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.53 
 
 		 508 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  41.33 
 
 		 472 aa  295  1e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.2 
 
 		 482 aa  293  3e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.57 
 
 		 486 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  43.67 
 
 		 470 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.76 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.23 
 
 		 470 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  41.11 
 
 		 470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.91 
 
 		 480 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.82 
 
 		 705 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  34.71 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.88 
 
 		 484 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.21 
 
 		 482 aa  276  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  34.49 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  35.06 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_19949  predicted protein  42.82 
 
 		 393 aa  265  2e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  37.47 
 
 		 550 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.55 
 
 		 472 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.96 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.13 
 
 		 473 aa  254  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  36.48 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  37.64 
 
 		 477 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.04 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  32.71 
 
 		 499 aa  249  9e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.08 
 
 		 459 aa  248  1e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  32.09 
 
 		 489 aa  247  3e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  32.53 
 
 		 460 aa  247  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  36.5 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  36.78 
 
 		 460 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  33.84 
 
 		 475 aa  246  6e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  35.56 
 
 		 459 aa  246  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.61 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.64 
 
 		 456 aa  243  6e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  35.83 
 
 		 745 aa  243  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  36 
 
 		 458 aa  243  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 		 489 aa  240  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.7 
 
 		 466 aa  240  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  35.78 
 
 		 458 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.36 
 
 		 459 aa  239  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.09 
 
 		 470 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.39 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.53 
 
 		 467 aa  236  8e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 		 458 aa  236  8e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  34 
 
 		 459 aa  236  9e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  36 
 
 		 453 aa  236  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  35.47 
 
 		 468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  34.32 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  34.22 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  35.79 
 
 		 459 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  32.58 
 
 		 464 aa  234  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.22 
 
 		 459 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  33.78 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  33.78 
 
 		 459 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.63 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>