More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2696 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  976    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.05 
 
 
475 aa  595  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  47.46 
 
 
469 aa  450  1e-125  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.98 
 
 
455 aa  418  9.999999999999999e-116  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  43.48 
 
 
462 aa  388  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.59 
 
 
488 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.38 
 
 
487 aa  316  5e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.08 
 
 
536 aa  300  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  34.29 
 
 
528 aa  282  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  34.39 
 
 
484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.77 
 
 
472 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  35.11 
 
 
466 aa  259  9e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.32 
 
 
478 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.79 
 
 
473 aa  256  6e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 
457 aa  256  8e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35 
 
 
475 aa  256  9e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.85 
 
 
475 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  32.78 
 
 
475 aa  249  8e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.54 
 
 
474 aa  246  9e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  33.33 
 
 
460 aa  239  9e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 
477 aa  238  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.91 
 
 
469 aa  236  8e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.02 
 
 
465 aa  233  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  31.81 
 
 
720 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  33.89 
 
 
459 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  30.28 
 
 
458 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  30.5 
 
 
458 aa  224  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.37 
 
 
459 aa  222  9e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  31.32 
 
 
458 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  31.87 
 
 
516 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  29.74 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  31.77 
 
 
469 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  30.94 
 
 
459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.7 
 
 
465 aa  221  3e-56  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.05 
 
 
463 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  29.25 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  29.25 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  30.72 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  30.72 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  32.45 
 
 
713 aa  219  7e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  30.59 
 
 
515 aa  219  7.999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  31.39 
 
 
510 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  31.36 
 
 
459 aa  218  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  32.9 
 
 
507 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  31.36 
 
 
459 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  34.34 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  31.57 
 
 
590 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  31.37 
 
 
459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  33.72 
 
 
510 aa  216  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.11 
 
 
712 aa  216  8e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  31.71 
 
 
470 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.08 
 
 
459 aa  215  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  30.8 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  31.65 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  31.85 
 
 
467 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.68 
 
 
458 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.13 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  32.09 
 
 
460 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  32.78 
 
 
546 aa  213  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.85 
 
 
722 aa  213  9e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  32.78 
 
 
546 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  30.44 
 
 
469 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31.3 
 
 
459 aa  211  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.11 
 
 
469 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  31.62 
 
 
546 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.12 
 
 
450 aa  209  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  30.26 
 
 
459 aa  209  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.79 
 
 
722 aa  209  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  31.09 
 
 
468 aa  209  7e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  29.13 
 
 
461 aa  209  9e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  30.17 
 
 
464 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  31.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  31.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  31.07 
 
 
470 aa  207  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  31.1 
 
 
453 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.33 
 
 
473 aa  207  5e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.58 
 
 
714 aa  206  7e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.75 
 
 
463 aa  206  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.41 
 
 
470 aa  206  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.59 
 
 
716 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  31.14 
 
 
459 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.67 
 
 
474 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  31.14 
 
 
459 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  31.14 
 
 
459 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.66 
 
 
713 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  32.33 
 
 
585 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  31.58 
 
 
550 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  30.62 
 
 
704 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.39 
 
 
462 aa  204  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  30.45 
 
 
717 aa  204  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  29.82 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  29.65 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  30.46 
 
 
487 aa  204  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  29.65 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.32 
 
 
462 aa  203  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  30.42 
 
 
458 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  29.65 
 
 
722 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  29.89 
 
 
505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  30.98 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  31.74 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>