More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1709 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  60.08 
 
 		 717 aa  881    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.69 
 
 		 722 aa  877    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 720 aa  1433    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  65.11 
 
 		 738 aa  952    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  66.05 
 
 		 716 aa  954    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  66.76 
 
 		 716 aa  953    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  51.76 
 
 		 704 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.88 
 
 		 712 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  60.25 
 
 		 722 aa  879    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.15 
 
 		 705 aa  657    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  63.9 
 
 		 717 aa  868    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  59.74 
 
 		 713 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  61.54 
 
 		 717 aa  905    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  65.54 
 
 		 722 aa  894    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  57.29 
 
 		 713 aa  795    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.14 
 
 		 746 aa  747    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  47.3 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35 
 
 		 714 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.55 
 
 		 714 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  45.03 
 
 		 510 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  45.45 
 
 		 516 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  45.73 
 
 		 515 aa  384  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.15 
 
 		 475 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.37 
 
 		 472 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.15 
 
 		 475 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  46.53 
 
 		 525 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  43.38 
 
 		 507 aa  362  1e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  44.69 
 
 		 513 aa  360  5e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  43.47 
 
 		 510 aa  360  7e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  42.83 
 
 		 507 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  41.62 
 
 		 507 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.62 
 
 		 473 aa  352  2e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  41.72 
 
 		 508 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.16 
 
 		 471 aa  350  6e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  41.43 
 
 		 509 aa  348  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.1 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.47 
 
 		 482 aa  345  2e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.84 
 
 		 482 aa  342  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.2 
 
 		 482 aa  337  5.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.99 
 
 		 472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  42.86 
 
 		 486 aa  327  6e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.64 
 
 		 480 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  42.92 
 
 		 470 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38.9 
 
 		 515 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.42 
 
 		 474 aa  318  3e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.54 
 
 		 475 aa  317  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.66 
 
 		 494 aa  316  8e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  44.22 
 
 		 520 aa  312  1e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.13 
 
 		 488 aa  312  2e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.83 
 
 		 484 aa  310  8e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.7 
 
 		 508 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  37.09 
 
 		 504 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.63 
 
 		 495 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  42.61 
 
 		 472 aa  301  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.48 
 
 		 470 aa  299  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  38.36 
 
 		 532 aa  290  7e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  37.17 
 
 		 546 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  41 
 
 		 470 aa  283  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.56 
 
 		 470 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  37.87 
 
 		 475 aa  272  1e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.25 
 
 		 473 aa  271  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 		 465 aa  270  5.9999999999999995e-71  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.81 
 
 		 472 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  38.12 
 
 		 557 aa  265  2e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.87 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  34.5 
 
 		 546 aa  264  4e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  37.17 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.72 
 
 		 466 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  34.13 
 
 		 546 aa  261  4e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.67 
 
 		 456 aa  260  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  38.28 
 
 		 767 aa  259  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 		 459 aa  258  3e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 		 458 aa  257  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.73 
 
 		 550 aa  257  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 		 459 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 		 468 aa  256  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 		 468 aa  256  9e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  36.88 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  37.83 
 
 		 767 aa  251  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  37.55 
 
 		 477 aa  250  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.44 
 
 		 458 aa  250  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.81 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.99 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.64 
 
 		 468 aa  248  2e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  37.09 
 
 		 457 aa  249  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 		 463 aa  248  3e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.37 
 
 		 463 aa  247  6.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  39 
 
 		 484 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.1 
 
 		 470 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  37.77 
 
 		 745 aa  246  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 		 459 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  57.08 
 
 		 231 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.72 
 
 		 468 aa  246  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.6 
 
 		 489 aa  244  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.46 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.04 
 
 		 466 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1998  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.12 
 
 		 481 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.48 
 
 		 473 aa  244  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.11 
 
 		 464 aa  244  6e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 473 aa  243  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>