More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1504 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1504  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 		 462 aa  933    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.515089  normal  0.0466141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  39.33 
 
 		 546 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  37.86 
 
 		 546 aa  316  5e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  40.44 
 
 		 546 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  37.64 
 
 		 546 aa  312  6.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0504  mercuric reductase  41.01 
 
 		 449 aa  310  4e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  41.68 
 
 		 548 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1504  mercuric reductase  39.78 
 
 		 453 aa  296  7e-79  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.25653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0654  mercuric reductase  38.63 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.87809e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0640  mercuric reductase  38.2 
 
 		 468 aa  288  1e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  38.18 
 
 		 550 aa  286  4e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  38.06 
 
 		 767 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  38.74 
 
 		 767 aa  285  9e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1241  mercuric reductase  38.51 
 
 		 448 aa  281  1e-74  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.446801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0177  mercuric reductase MerA  37.58 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  38.46 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  37.37 
 
 		 469 aa  279  8e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1148  mercuric reductase  40.13 
 
 		 457 aa  277  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0182955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  38.14 
 
 		 745 aa  276  8e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3424  mercuric reductase  37.21 
 
 		 468 aa  274  3e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0690  mercuric reductase  39.01 
 
 		 481 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.192452  normal  0.6373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  37.14 
 
 		 475 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  36.18 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  35.19 
 
 		 503 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2649  mercuric reductase  38.25 
 
 		 478 aa  252  8.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.46 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0483  putative mercuric reductase  36.25 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2329  mercuric reductase  34.75 
 
 		 476 aa  249  5e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1778  mercuric reductase  36.71 
 
 		 480 aa  250  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.3364  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  36.79 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1340  putative mercuric reductase  36.79 
 
 		 562 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.657387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  35.87 
 
 		 557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  33.89 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1158  mercuric reductase  35.75 
 
 		 484 aa  243  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0843858  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1213  putative mercuric reductase  35.04 
 
 		 561 aa  243  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4465  mercuric reductase  36.92 
 
 		 476 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4296  mercuric reductase  36.92 
 
 		 476 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4196  mercuric reductase  36.92 
 
 		 476 aa  243  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1341  putative mercuric reductase  37.25 
 
 		 541 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.183471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5372  mercuric reductase  36.02 
 
 		 477 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  32.97 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  33.12 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0165  putative mercuric reductase  34.97 
 
 		 561 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1298  putative mercuric reductase  35.96 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.881891 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2338  putative mercuric reductase  34.62 
 
 		 561 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4345  putative mercuric reductase  35.39 
 
 		 561 aa  237  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2481  putative mercuric reductase  34.79 
 
 		 547 aa  236  7e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0761993  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1209  mercuric reductase  35.12 
 
 		 565 aa  236  8e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.375903  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6495  putative mercuric reductase  34.4 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0104  putative mercuric reductase  34.4 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.57639  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6174  putative mercuric reductase  34.4 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00111286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6183  putative mercuric reductase  34.4 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00236829  unclonable  0.0000000913433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15460  putative mercuric reductase  34.4 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000698922  unclonable  2.1869799999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  34.22 
 
 		 486 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.13 
 
 		 484 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1787  putative mercuric reductase  35.61 
 
 		 561 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.152452  normal  0.329261 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2107  putative mercuric reductase  34.57 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4511  mercuric reductase  34.25 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00955631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3663  mercuric reductase  36.43 
 
 		 458 aa  233  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2228  putative mercuric reductase  34.05 
 
 		 561 aa  232  8.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.14729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.45 
 
 		 473 aa  232  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2133  putative mercuric reductase  34.9 
 
 		 564 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0045  putative mercuric reductase  34.9 
 
 		 564 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00619698  normal  0.422186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 		 459 aa  231  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.83 
 
 		 480 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01408  putative mercuric reductase  32.28 
 
 		 479 aa  230  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.85 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 		 462 aa  229  9e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34 
 
 		 475 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4946  mercuric reductase  36.13 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104965  decreased coverage  0.00400898 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.79 
 
 		 466 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.61 
 
 		 508 aa  227  3e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0090  putative mercuric reductase  35.39 
 
 		 560 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  33.77 
 
 		 489 aa  226  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2009  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.06 
 
 		 471 aa  226  7e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 		 488 aa  226  8e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1213  mercuric reductase  34.27 
 
 		 464 aa  225  1e-57  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3213  mercuric reductase  34.77 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0163863  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.69 
 
 		 467 aa  224  2e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  34.12 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 468 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.96 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06150  mercuric reductase  36.15 
 
 		 474 aa  223  6e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02044  putative mercuric reductase  31.91 
 
 		 479 aa  223  8e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.985853  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0168  putative mercuric reductase  32.9 
 
 		 550 aa  222  9e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  31.04 
 
 		 458 aa  222  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.89 
 
 		 489 aa  221  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25620  mercuric reductase  35.94 
 
 		 474 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.11 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4311  putative mercuric reductase  32.2 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.92 
 
 		 499 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.69 
 
 		 464 aa  219  7e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.94 
 
 		 475 aa  219  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  34.12 
 
 		 714 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.9 
 
 		 472 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2105  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  33.26 
 
 		 448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0584847  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.64 
 
 		 562 aa  217  4e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.6 
 
 		 470 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.3 
 
 		 465 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>