More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5878 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  70.02 
 
 
466 aa  664    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  100 
 
 
460 aa  924    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  64.09 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.02 
 
 
478 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.03 
 
 
469 aa  504  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  55.79 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  55.08 
 
 
470 aa  480  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  55.05 
 
 
469 aa  481  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  53.12 
 
 
470 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  53.12 
 
 
470 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  53.12 
 
 
470 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  53.62 
 
 
475 aa  463  1e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  52.6 
 
 
464 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  51.19 
 
 
469 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  52.06 
 
 
477 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.16 
 
 
474 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  48.22 
 
 
487 aa  410  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  47.22 
 
 
468 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  45.92 
 
 
467 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
487 aa  282  7.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.76 
 
 
488 aa  278  1e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  36.82 
 
 
536 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.58 
 
 
484 aa  274  2.0000000000000002e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 
462 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.62 
 
 
457 aa  259  7e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.47 
 
 
528 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.98 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 
459 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
476 aa  239  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 
469 aa  237  4e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  32.51 
 
 
546 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  33.33 
 
 
459 aa  231  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.8 
 
 
458 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.25 
 
 
460 aa  230  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  35.14 
 
 
459 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.77 
 
 
459 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.77 
 
 
459 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  35 
 
 
458 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.85 
 
 
459 aa  229  1e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.2 
 
 
459 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.2 
 
 
590 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  34.54 
 
 
479 aa  227  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.56 
 
 
459 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  35 
 
 
458 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  33.99 
 
 
459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.12 
 
 
459 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  30.68 
 
 
464 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  30.45 
 
 
464 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  31.25 
 
 
460 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  34.56 
 
 
459 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  35.19 
 
 
448 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.83 
 
 
459 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.83 
 
 
459 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.03 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.9 
 
 
767 aa  222  9e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  35.36 
 
 
745 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.8 
 
 
458 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  32.83 
 
 
459 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.13 
 
 
459 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  34.08 
 
 
448 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  31.88 
 
 
459 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.84 
 
 
472 aa  219  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  33.62 
 
 
466 aa  219  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  35.77 
 
 
550 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1741  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.12 
 
 
459 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.82983  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.05 
 
 
546 aa  218  2e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  32.55 
 
 
467 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.24 
 
 
473 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.11 
 
 
546 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  31.51 
 
 
455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.03 
 
 
472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  32.32 
 
 
461 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.25 
 
 
475 aa  216  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.25 
 
 
475 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  32.61 
 
 
459 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  33.48 
 
 
460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.04 
 
 
459 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.83 
 
 
457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  33.19 
 
 
466 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  30.41 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.2 
 
 
460 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2549  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
471 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.88 
 
 
767 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  32.18 
 
 
546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  34.42 
 
 
452 aa  212  9e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.12 
 
 
456 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
616 aa  211  2e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.49 
 
 
463 aa  211  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  33.11 
 
 
475 aa  211  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.61 
 
 
473 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5475  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
466 aa  210  4e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67474  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  32.75 
 
 
452 aa  209  6e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  35.71 
 
 
548 aa  209  6e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5367  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.26 
 
 
467 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.352154  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0794  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
464 aa  209  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0822036  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.18 
 
 
467 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0176  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.87 
 
 
451 aa  208  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  31.3 
 
 
459 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  31.3 
 
 
459 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.76 
 
 
464 aa  208  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>