More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0977 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  70.36 
 
 
717 aa  1074    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  72.66 
 
 
716 aa  1082    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1392  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  95.98 
 
 
722 aa  1427    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  68.38 
 
 
738 aa  1050    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1621  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  65.6 
 
 
716 aa  994    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143809  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  48.55 
 
 
704 aa  703    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3219  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.15 
 
 
712 aa  726    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  62.39 
 
 
722 aa  936    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0977  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
722 aa  1472    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0805308 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2701  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  63.97 
 
 
717 aa  934    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418324  normal  0.488956 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  60.25 
 
 
720 aa  854    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  56.11 
 
 
713 aa  830    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2957  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  76.8 
 
 
717 aa  1169    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2767  mercuric reductase, membrane-associated  53.47 
 
 
713 aa  717    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.412379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  55.59 
 
 
746 aa  756    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.67 
 
 
705 aa  633  1e-180  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  35.52 
 
 
714 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  35.37 
 
 
714 aa  389  1e-107  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.32 
 
 
475 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.87 
 
 
473 aa  373  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.32 
 
 
475 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.63 
 
 
472 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1598  mercuric reductase  42.33 
 
 
510 aa  352  1e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1976  mercuric reductase  40.9 
 
 
515 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121394  normal  0.267836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1315  mercuric reductase  38.23 
 
 
505 aa  333  6e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  39.32 
 
 
516 aa  331  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3749  mercuric reductase  37.47 
 
 
510 aa  332  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1982  mercuric reductase  39.14 
 
 
507 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2431  mercuric reductase  39.47 
 
 
509 aa  326  1e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0302245 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0341  mercuric reductase  38.68 
 
 
513 aa  325  1e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.262154  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2535  mercuric reductase  38.51 
 
 
508 aa  319  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  37.63 
 
 
507 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.79 
 
 
472 aa  318  2e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  40.85 
 
 
486 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1481  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.17 
 
 
494 aa  314  3.9999999999999997e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  36.2 
 
 
507 aa  311  4e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1239  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.23 
 
 
495 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.375161 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1429  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  38 
 
 
515 aa  301  2e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.905339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.53 
 
 
482 aa  300  6e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0315  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.5 
 
 
471 aa  300  6e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0352  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.44 
 
 
475 aa  298  3e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0304  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.36 
 
 
474 aa  296  8e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0309  mercuric reductase  37.18 
 
 
525 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1956  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.75 
 
 
480 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0751  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.15 
 
 
473 aa  291  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1498  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.94 
 
 
488 aa  288  2e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000511741  hitchhiker  0.0000458564 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4668  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.01 
 
 
482 aa  288  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4228  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.9 
 
 
482 aa  280  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0335  putative mercuric reductase MerA  38.3 
 
 
470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0257756  normal  0.865003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.33 
 
 
484 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0898  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.75 
 
 
508 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00115945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6515  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.46 
 
 
520 aa  269  1e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0072  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.74 
 
 
470 aa  268  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1057  putative mercuric reductase protein  35.53 
 
 
470 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2549  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.81 
 
 
472 aa  263  6.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0494976  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3132  mercuric reductase  32.73 
 
 
504 aa  263  8.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2718  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.32 
 
 
470 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.403702  normal  0.0190809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0645  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation protein  36.32 
 
 
472 aa  257  4e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  36.13 
 
 
546 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16069  predicted protein  34.72 
 
 
532 aa  250  6e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258027  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  34.33 
 
 
503 aa  247  6.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  34.33 
 
 
467 aa  246  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.19 
 
 
465 aa  244  6e-63  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  33.91 
 
 
546 aa  243  6e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_638  mercuric reductase-like protein  33.91 
 
 
499 aa  243  7e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000028153  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  33.91 
 
 
546 aa  243  7.999999999999999e-63  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0732  mercuric reductase, putative  33.05 
 
 
489 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000844078  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.62 
 
 
468 aa  241  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0664  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.77 
 
 
489 aa  241  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.84 
 
 
473 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.32 
 
 
562 aa  239  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
463 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  35.61 
 
 
477 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  31.58 
 
 
460 aa  236  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  30.11 
 
 
550 aa  235  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6297  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.68 
 
 
466 aa  235  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.533551 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0084  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.97 
 
 
473 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  33.04 
 
 
548 aa  234  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  35.21 
 
 
546 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  32.5 
 
 
464 aa  232  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.67 
 
 
767 aa  232  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1270  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.41 
 
 
460 aa  230  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.751643  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.99 
 
 
459 aa  230  6e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2758  putative mercuric reductase  33.41 
 
 
468 aa  228  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1388  mercuric reductase  33.64 
 
 
557 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000433137  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  32.05 
 
 
464 aa  228  4e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1462  hypothetical protein  58.17 
 
 
233 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.376963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2552  SNARE associated Golgi protein  54.09 
 
 
231 aa  227  6e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.42 
 
 
473 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.49 
 
 
473 aa  226  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1081  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 
481 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378558  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1042  SNARE associated Golgi protein  50.66 
 
 
236 aa  224  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.406672 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
465 aa  224  4.9999999999999996e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  32.1 
 
 
464 aa  224  6e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.27 
 
 
484 aa  223  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.1 
 
 
463 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.88 
 
 
484 aa  223  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.4 
 
 
470 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1334  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  32.83 
 
 
452 aa  223  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.106224 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2120  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.56 
 
 
481 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.203101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>