More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  70.02 
 
 		 460 aa  664    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  100 
 
 		 466 aa  942    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  62.55 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  58.03 
 
 		 469 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.49 
 
 		 478 aa  509  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  55.53 
 
 		 459 aa  495  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  53.15 
 
 		 469 aa  478  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  53.49 
 
 		 475 aa  476  1e-133  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  52.62 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  52.62 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  52.62 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  53.08 
 
 		 470 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  53.66 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  53.94 
 
 		 469 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  52.87 
 
 		 474 aa  434  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  49.35 
 
 		 477 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  46.51 
 
 		 468 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13800  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  46.94 
 
 		 487 aa  395  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.162356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  45.44 
 
 		 467 aa  376  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  40.51 
 
 		 536 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  38.57 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.14 
 
 		 487 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 		 462 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  37.34 
 
 		 488 aa  277  3e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 		 457 aa  272  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  33.8 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.11 
 
 		 476 aa  259  9e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.41 
 
 		 475 aa  251  3e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.12 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.12 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  34.12 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  33.97 
 
 		 458 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  33.76 
 
 		 458 aa  239  8e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  33.91 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0283  mercuric reductase  34.84 
 
 		 590 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0194  mercuric reductase  34.84 
 
 		 459 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  34.32 
 
 		 467 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1652  mercuric reductase  34.62 
 
 		 459 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.52 
 
 		 458 aa  236  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  33.26 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  33.12 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  33.12 
 
 		 459 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  33.55 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.41 
 
 		 459 aa  230  4e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0395  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.39 
 
 		 713 aa  228  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  34.02 
 
 		 466 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  33.55 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  30.9 
 
 		 460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1496  mercuric reductase  33.76 
 
 		 466 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.32667 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0314  hypothetical protein  31.45 
 
 		 464 aa  223  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0298  hypothetical protein  31.31 
 
 		 464 aa  223  4.9999999999999996e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  34.19 
 
 		 459 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.55 
 
 		 467 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  32.48 
 
 		 457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0840  mercuric reductase  31.29 
 
 		 459 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.909893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3674  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.51 
 
 		 460 aa  220  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.151121  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  34.31 
 
 		 479 aa  219  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.48 
 
 		 456 aa  219  8.999999999999998e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4636  mercuric reductase  29.93 
 
 		 458 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.295825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3669  mercuric reductase  34.46 
 
 		 459 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  31.6 
 
 		 455 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4010  putative mercuric reductase  33.03 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.75 
 
 		 457 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  34.87 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  29.27 
 
 		 457 aa  216  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.86 
 
 		 459 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4997  mercuric reductase  31.65 
 
 		 459 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  30.67 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.32 
 
 		 546 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  32.27 
 
 		 716 aa  211  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.32 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  31.25 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  31.25 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  31.25 
 
 		 459 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  29.89 
 
 		 455 aa  209  1e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  32.96 
 
 		 767 aa  208  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.64 
 
 		 767 aa  207  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 		 471 aa  207  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.91 
 
 		 467 aa  206  6e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.64 
 
 		 460 aa  206  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.3 
 
 		 463 aa  205  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.32 
 
 		 546 aa  204  2e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2876  mercuric reductase  30.72 
 
 		 458 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00432777 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.42 
 
 		 467 aa  205  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.85 
 
 		 467 aa  204  3e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  33.11 
 
 		 745 aa  204  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.79 
 
 		 459 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0507  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.63 
 
 		 464 aa  203  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  29.16 
 
 		 546 aa  203  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.37 
 
 		 465 aa  202  7e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  31.44 
 
 		 467 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  31.21 
 
 		 503 aa  202  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  31.21 
 
 		 519 aa  202  9.999999999999999e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.28 
 
 		 467 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3059  mercuric reductase  30.84 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0658861 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.14 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2443  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.85 
 
 		 469 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.06 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1509  mercuric reductase  30 
 
 		 461 aa  200  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.344309  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>