More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1256 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2738  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  72.23 
 
 
488 aa  680    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3630  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  70.26 
 
 
536 aa  683    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.353308  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1256  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  968    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1804  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  46.72 
 
 
528 aa  416  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0256  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  47.5 
 
 
484 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0842  dihydrolipoamide dehydrogenase  45.44 
 
 
457 aa  363  4e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.754028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2696  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.66 
 
 
476 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.303551  normal  0.202311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.76 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1783  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 
475 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1824  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.35 
 
 
469 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.372731  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.66 
 
 
455 aa  305  9.000000000000001e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3488  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.45 
 
 
478 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.531012  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10080  mycothione reductase  37.14 
 
 
466 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0975361  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5878  mycothione reductase  37.76 
 
 
460 aa  282  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05900  dihydrolipoamide dehydrogenase  40.04 
 
 
477 aa  280  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.257436 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2130  mycothione reductase  38.32 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2195  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.81 
 
 
469 aa  266  7e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000774241  hitchhiker  0.00141169 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2050  mycothione reductase  36.76 
 
 
470 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2113  mycothione reductase  36.76 
 
 
470 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.207955  normal  0.0141084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2067  mycothione reductase  36.76 
 
 
470 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.159989  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2298  mycothione reductase  37.24 
 
 
469 aa  262  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.270268 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  36.29 
 
 
465 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 
468 aa  258  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1696  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  36.34 
 
 
469 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.142602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  37.11 
 
 
468 aa  256  7e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4054  mycothione reductase  35.88 
 
 
470 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.75 
 
 
585 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 
459 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12870  mycothione reductase  35.4 
 
 
459 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.135712  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08580  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  36.9 
 
 
467 aa  250  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.745964 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3360  dihydrolipoyl dehydrogenanse  34.39 
 
 
466 aa  248  2e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0306833 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  34.24 
 
 
468 aa  243  7e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.36 
 
 
492 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.17 
 
 
463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09170  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex, dihydrolipoamide dehydrogenase component  32.65 
 
 
475 aa  236  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.55 
 
 
469 aa  234  3e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4940  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.98 
 
 
472 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1665  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.76 
 
 
491 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.771016  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3872  mercuric reductase  33.83 
 
 
459 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.429317 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5056  mercuric reductase  32.55 
 
 
459 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.135768 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4715  mercuric reductase  34.04 
 
 
459 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  32.35 
 
 
464 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3648  mercuric reductase  34.04 
 
 
459 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.948829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.49 
 
 
466 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.3 
 
 
458 aa  231  3e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1496  mercuric reductase  35.42 
 
 
467 aa  230  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3348  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.08 
 
 
473 aa  230  5e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602817  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.43 
 
 
468 aa  229  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.08 
 
 
475 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1643  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.23 
 
 
474 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000472029 
 
 
-
 
NC_003296  RS02078  mercuric reductase  34.04 
 
 
459 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.66 
 
 
475 aa  227  3e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1835  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.04 
 
 
470 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2847  mercuric reductase  35.02 
 
 
484 aa  226  7e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.4 
 
 
473 aa  226  9e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2994  mercuric reductase  35.38 
 
 
485 aa  226  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
470 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  35.17 
 
 
745 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  34.03 
 
 
459 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0385  mercuric reductase  32.35 
 
 
459 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.32 
 
 
456 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3468  mercuric reductase  31.98 
 
 
457 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211907  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5390  mercuric reductase  32.98 
 
 
458 aa  223  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4235  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1472  mercuric reductase  34.96 
 
 
473 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.505901  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.76 
 
 
472 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5011  mercuric reductase  33.13 
 
 
459 aa  222  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1035  normal  0.205591 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.3 
 
 
463 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4273  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.64 
 
 
473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2133  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 
467 aa  221  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.191316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  29.08 
 
 
460 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0961  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  221  3e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0328165 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.61 
 
 
479 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4004  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4068  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6263  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
468 aa  220  3.9999999999999997e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.202471 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4183  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.44 
 
 
473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000040405 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.99 
 
 
462 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3551  mercuric reductase  32.55 
 
 
458 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895988  normal  0.343975 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 
462 aa  219  6e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.03 
 
 
466 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3897  mercuric reductase  32.63 
 
 
459 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.423332 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  31.93 
 
 
453 aa  219  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.51 
 
 
466 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4011  mercuric reductase  32.63 
 
 
459 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0854657  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.02 
 
 
474 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.75 
 
 
467 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.65 
 
 
467 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2206  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.19 
 
 
459 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.041685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.42 
 
 
562 aa  218  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.68 
 
 
468 aa  218  2.9999999999999998e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  34.67 
 
 
767 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  31.79 
 
 
714 aa  217  4e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.83 
 
 
467 aa  217  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1463  mercuric reductase, putative  33.2 
 
 
486 aa  217  4e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0144411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1668  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.46 
 
 
459 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0297676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>