More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_14591 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.32 
 
 
481 aa  761    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.61 
 
 
479 aa  899    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.57 
 
 
480 aa  778    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 
480 aa  753    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.85 
 
 
480 aa  751    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.81 
 
 
479 aa  899    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.26 
 
 
479 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.4 
 
 
479 aa  894    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  74.69 
 
 
489 aa  766    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.57 
 
 
480 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
479 aa  975    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 
476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.06 
 
 
476 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.12 
 
 
477 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.96 
 
 
475 aa  558  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.51 
 
 
476 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.6 
 
 
476 aa  557  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.39 
 
 
478 aa  547  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  52.39 
 
 
543 aa  513  1e-144  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  53.98 
 
 
462 aa  492  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.07 
 
 
470 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 
465 aa  274  3e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.54 
 
 
470 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
458 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
465 aa  269  5.9999999999999995e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
463 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  268  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  268  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 
465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.5 
 
 
585 aa  265  8.999999999999999e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
462 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.53 
 
 
462 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 
470 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.71 
 
 
466 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 
467 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.88 
 
 
459 aa  262  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.91 
 
 
602 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 
607 aa  261  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.86 
 
 
562 aa  262  1e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
473 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 
465 aa  260  3e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.87 
 
 
593 aa  261  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
470 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.02 
 
 
470 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
475 aa  259  6e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
479 aa  259  7e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.23 
 
 
467 aa  259  8e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.02 
 
 
467 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.94 
 
 
466 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.24 
 
 
478 aa  257  3e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 
470 aa  257  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.72 
 
 
466 aa  257  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.19 
 
 
468 aa  257  3e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.62 
 
 
492 aa  257  4e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 
469 aa  256  6e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.83 
 
 
462 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.64 
 
 
466 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.68 
 
 
475 aa  256  9e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1621  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.81 
 
 
463 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.68 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.06 
 
 
473 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1086  dihydrolipoyl dehydrogenase (dihydrolipoamide dehydrogenase)  34.24 
 
 
464 aa  254  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.912162  normal  0.114778 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.7 
 
 
469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.37 
 
 
484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.97 
 
 
462 aa  253  4.0000000000000004e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.76 
 
 
470 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 
466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.49 
 
 
464 aa  253  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.07 
 
 
467 aa  253  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.08 
 
 
466 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06220  Dihydrolipoyl dehydrogenase  34.53 
 
 
468 aa  253  6e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 
466 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 
478 aa  253  7e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 
465 aa  253  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.47 
 
 
462 aa  253  7e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.44 
 
 
466 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
466 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.74 
 
 
480 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.24 
 
 
468 aa  252  9.000000000000001e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.67 
 
 
462 aa  252  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 
478 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 
466 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.9 
 
 
478 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3906  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
473 aa  251  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3915  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
473 aa  251  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.616169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7193  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.68 
 
 
619 aa  251  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  32.72 
 
 
479 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 
473 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4385  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
473 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
472 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.82 
 
 
593 aa  251  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4293  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.53 
 
 
473 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00988319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>