More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3171 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  76.97 
 
 
477 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.52 
 
 
476 aa  696    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.89 
 
 
475 aa  713    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  72 
 
 
478 aa  701    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.4 
 
 
479 aa  661    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  71.79 
 
 
476 aa  702    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  72.42 
 
 
476 aa  704    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 
476 aa  969    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.31 
 
 
480 aa  598  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.62 
 
 
481 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.43 
 
 
489 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.1 
 
 
480 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  60.08 
 
 
480 aa  585  1e-166  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.15 
 
 
480 aa  581  1e-164  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.6 
 
 
479 aa  579  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.15 
 
 
479 aa  576  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.72 
 
 
479 aa  574  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 
479 aa  571  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  57.53 
 
 
543 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  57.54 
 
 
462 aa  523  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.67 
 
 
463 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.91 
 
 
475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.61 
 
 
465 aa  282  8.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.78 
 
 
458 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.82 
 
 
470 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.91 
 
 
458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.97 
 
 
472 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.32 
 
 
465 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1192  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.01 
 
 
478 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.523433  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1099  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.01 
 
 
478 aa  273  7e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2048  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.73 
 
 
474 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.47477  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1271  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 
478 aa  272  9e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.547338 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1616  dihydrolipoamide dehydrogenase  38 
 
 
478 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3772  normal  0.120385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5671  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.1 
 
 
466 aa  271  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3510  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0716172  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4187  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 
478 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.265886  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1582  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.45 
 
 
467 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.71 
 
 
467 aa  269  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.05 
 
 
465 aa  269  8e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0926  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.73 
 
 
467 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.566278  normal  0.378334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3758  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.41 
 
 
478 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2554  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.8 
 
 
476 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.40022  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.5 
 
 
467 aa  268  1e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0837  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 
462 aa  268  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0629808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2201  2-oxoglutarate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00788973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1667  dihydrolipoamide dehydrogenase  38.2 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.164593  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2011  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.156976  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.65 
 
 
473 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1132  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.2 
 
 
464 aa  267  4e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.487543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2045  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.25 
 
 
474 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0329202  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1720  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.21 
 
 
465 aa  266  4e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.160596  normal  0.364813 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3710  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.99 
 
 
467 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2323  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.05 
 
 
464 aa  265  1e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1752  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1926  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3687  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.338346  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2810  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.14 
 
 
476 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0361111  normal  0.13581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3705  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.45 
 
 
468 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1774  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  265  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43970  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.95 
 
 
478 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0508378  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.26 
 
 
466 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.95 
 
 
470 aa  263  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3504  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.23 
 
 
465 aa  263  4e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2501  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.53 
 
 
478 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.84 
 
 
459 aa  263  6e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1219  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.17 
 
 
479 aa  263  6e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.14 
 
 
464 aa  263  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3549  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.94 
 
 
468 aa  263  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4651  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  262  8e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183592  normal  0.254899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5416  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.79 
 
 
466 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1608  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.84 
 
 
481 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.392675  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.99 
 
 
466 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2179  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
468 aa  261  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26432  dihydrolipoyl dehydrogenase  35.9 
 
 
500 aa  261  1e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1745  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.17 
 
 
476 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00176702 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.25 
 
 
466 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1719  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.93 
 
 
476 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.92 
 
 
469 aa  261  1e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1801  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
482 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.656654  decreased coverage  0.000698264 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1379  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.2 
 
 
496 aa  261  2e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1496  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1050  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.164535  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1002  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.219613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0164  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 
476 aa  261  2e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.56 
 
 
466 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.52 
 
 
466 aa  261  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2012  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.26 
 
 
478 aa  261  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.723909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  37 
 
 
470 aa  260  4e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.54 
 
 
470 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.32 
 
 
468 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.61 
 
 
473 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.18 
 
 
460 aa  260  5.0000000000000005e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  259  6e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.05 
 
 
462 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  259  6e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 
470 aa  259  6e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 
473 aa  259  7e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.250901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>