More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1394 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0864  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.37 
 
 		 480 aa  774    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.192973  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1530  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.64 
 
 		 480 aa  752    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.411134  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0869  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.01 
 
 		 480 aa  749    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1394  dihydrolipoamide dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  972    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1198  dihydrolipoamide dehydrogenase  65.13 
 
 		 479 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.217034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14591  dihydrolipoamide dehydrogenase  90.81 
 
 		 479 aa  899    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.024787  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14971  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.75 
 
 		 479 aa  963    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.223464  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14831  dihydrolipoamide dehydrogenase  98.54 
 
 		 479 aa  959    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.509805  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19781  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.43 
 
 		 489 aa  758    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13451  dihydrolipoamide dehydrogenase  73.9 
 
 		 481 aa  757    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0908915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17171  dihydrolipoamide dehydrogenase  75.78 
 
 		 480 aa  778    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3920  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.28 
 
 		 476 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3968  dihydrolipoamide dehydrogenase  61.49 
 
 		 476 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5041  dihydrolipoamide dehydrogenase  59.66 
 
 		 477 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3171  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.72 
 
 		 476 aa  552  1e-156  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1927  dihydrolipoamide dehydrogenase  58.3 
 
 		 475 aa  551  1e-155  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0099  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.42 
 
 		 476 aa  545  1e-154  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0247  dihydrolipoamide dehydrogenase  57.54 
 
 		 478 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0691299 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30113  lipoamide dehydrogenase  53.43 
 
 		 543 aa  516  1.0000000000000001e-145  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15203  predicted protein  55.31 
 
 		 462 aa  493  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000969694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.56 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.42 
 
 		 470 aa  277  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.97 
 
 		 458 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0955  dihydrolipoamide dehydrogenase  37.02 
 
 		 470 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.205743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0515  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 463 aa  269  8.999999999999999e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.023508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3995  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.19 
 
 		 465 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0162306  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.88 
 
 		 465 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1763  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.76 
 
 		 459 aa  266  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.733287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4072  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3712  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1168  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4018  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.761112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3728  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4088  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000285775  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3234  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.33 
 
 		 475 aa  264  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3796  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.26 
 
 		 470 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00896053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 		 462 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.03 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3520  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.12 
 
 		 602 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.501053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.48 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2671  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.4 
 
 		 470 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000595879  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.13 
 
 		 585 aa  259  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1045  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.89 
 
 		 469 aa  259  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.722929 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03103  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.83 
 
 		 607 aa  259  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0347  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.15 
 
 		 470 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2913  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.38 
 
 		 479 aa  257  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00695223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3594  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 492 aa  258  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.31 
 
 		 465 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63850  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.18 
 
 		 467 aa  257  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1822  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.37 
 
 		 484 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154015  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6519  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.75 
 
 		 478 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1911  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.52 
 
 		 603 aa  256  5e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00687521  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2832  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.44 
 
 		 463 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1981  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.75 
 
 		 603 aa  256  9e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.01171  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4459  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.43 
 
 		 473 aa  256  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.250901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2493  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.91 
 
 		 472 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.43654  normal  0.597636 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0027  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.02 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0271  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.46 
 
 		 593 aa  255  1.0000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.32 
 
 		 473 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3197  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.4 
 
 		 605 aa  254  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0142  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.11 
 
 		 475 aa  254  3e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.262371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5752  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.62 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1130  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.09 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392309  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3001  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.54 
 
 		 462 aa  254  3e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0472874  normal  0.642083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7124  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.1 
 
 		 467 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2807  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.61 
 
 		 473 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.831058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3609  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.97 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40318  normal  0.0347499 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0522  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.98 
 
 		 480 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1508  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.94 
 
 		 480 aa  253  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270354  normal  0.468663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1035  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.22 
 
 		 593 aa  253  5.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.356313  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.04 
 
 		 462 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2155  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.32 
 
 		 465 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2108  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.96 
 
 		 484 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1104  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550844  normal  0.0253682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2506  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.65 
 
 		 470 aa  253  7e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2813  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.72 
 
 		 466 aa  253  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6035  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 466 aa  252  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2038  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.17 
 
 		 484 aa  252  9.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  35.55 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12463  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.6 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.931129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1878  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 466 aa  251  2e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.932595  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2397  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.88 
 
 		 468 aa  251  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00706968 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3205  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.41 
 
 		 473 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.169727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.98 
 
 		 470 aa  250  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5274  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 		 466 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.409893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2766  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.16 
 
 		 473 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1648  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 467 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2857  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.96 
 
 		 473 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5145  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.23 
 
 		 466 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.671755  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5366  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.52 
 
 		 466 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.997164 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.66 
 
 		 468 aa  250  4e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2790  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.75 
 
 		 479 aa  250  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1930  dihydrolipoamide dehydrogenase  35.38 
 
 		 467 aa  250  4e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5901  dihydrolipoamide dehydrogenase  33.47 
 
 		 478 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  34.83 
 
 		 468 aa  249  5e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21030  dihydrolipoamide dehydrogenase  36.5 
 
 		 562 aa  250  5e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000667155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>